RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 DBX2Q6ZNG2 339 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 UBL4BQ8N7F7 174 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 PAF1Q8N7H5 531 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 DENND6BQ8NEG7 585 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 GDF3Q9NR23 364 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 GPR27Q9NS67 375 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 HAUS2Q9NVX0 235 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 B4GALT6Q9UBX8 382 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 TRPM6Q9BX84 2022 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD36A6QL64 1941 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 CFAP69A5D8W1 941 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 A6NNZ2 444 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 A8MX80 341 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 FPGTO14772 594 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 DFNA5O60443 496 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 MAGEC1O60732 1142 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 GM2AP17900 193 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 IGFALSP35858 605 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 CD86P42081 329 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 WASHC5Q12768 1159 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 AGERQ15109 404 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 Q6ZSR6 202 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 FAM174AQ8TBP5 190 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 SCRN2Q96FV2 425 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 AGAP3Q96P47 875 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 SMIM14Q96QK8 99 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 CHKBQ9Y259 395 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 HACD1B0YJ81 288 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 GIPC1O14908 333 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 SH3BP5O60239 455 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 KCNK5O95279 499 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 CTPS1P17812 591 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 LHCGRP22888 699 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 VIPR1P32241 457 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 RXRGP48443 463 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 CCT8P50990 548 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 PFN3P60673 137 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 IL9RQ01113 521 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 XRCC4Q13426 336 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 PPM1JQ5JR12 505 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 TPRG1LQ5T0D9 272 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 DEFB124Q8NES8 71 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 ACTL9Q8TC94 416 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 TADA1Q96BN2 335 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 TEKT5Q96M29 485 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 CAMK1GQ96NX5 476 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP15.78■□□□□ 0.123e-13■□□□□ 8.7
ACTB-206ENST00000443528 CAAP1Q9H8G2 361 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 C10orf88Q9H8K7 445 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 GLOD4Q9HC38 313 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 TMEM131Q92545 1883 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 KNL1Q8NG31 2342 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 A0A0U1RQS6 177 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 NRDCO43847 1150 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 PCDHGA12O60330 932 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 TJP3O95049 919 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 ALPIP09923 528 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 ELFN1P0C7U0 828 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 CD68P34810 354 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 HNF1BP35680 557 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 CETN2P41208 172 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 RABIFP47224 123 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 BNIP3Q12983 259 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 LRRC14Q15048 493 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 IRF4Q15306 451 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 CNGA3Q16281 694 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 MEI1Q5TIA1 1274 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 CCDC181Q5TID7 509 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 TSPAN33Q86UF1 283 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 NAXDQ8IW45 347 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 SPATA22Q8NHS9 363 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 HTR3CQ8WXA8 447 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 COQ10AQ96MF6 247 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-206ENST00000443528 SLC25A51Q9H1U9 297 aa15.77■□□□□ 0.12
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