RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		12.74	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	GLI3	P10071	1580 aa		12.74	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	CPD	O75976	1380 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		12.71	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		12.71	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	ATRN	O75882	1429 aa		12.7	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		12.69	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		12.69	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	MORC1	Q86VD1	984 aa		12.69	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		12.68	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477		A0A0G2JS52	829 aa		12.68	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	AMPH	P49418	695 aa		12.68	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	EVA1C	P58658	441 aa		12.68	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	MYT1	Q01538	1121 aa		12.68	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	RGS12	O14924	1447 aa		12.68	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	HOXC9	P31274	260 aa		12.67	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		12.67	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	POLK	Q9UBT6	870 aa		12.67	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	ERBB3	P21860	1342 aa		12.67	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		12.66	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		12.66	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	RXRB	P28702	533 aa		12.65	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	FAM182B	Q5T319	152 aa		12.65	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		12.65	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	NSD2	O96028	1365 aa		12.65	□□□□□ -0.38
MLH1-222	ENST00000539477	VPS72	Q15906	364 aa		12.64	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		12.64	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		12.64	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		12.64	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		12.64	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	FLT4	P35916	1363 aa		12.64	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	IP6K1	Q92551	441 aa		12.64	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		12.64	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	CRB1	P82279	1406 aa		12.63	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	LRRC37A3	O60309	1634 aa		12.62	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		12.62	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	ABCC6	O95255	1503 aa		12.62	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	MTHFS	P49914	203 aa		12.62	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		12.61	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	NBPF4	Q96M43	638 aa		12.61	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	RTL1	A6NKG5	1358 aa		12.6	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		12.6	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	12.6	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		12.6	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	INSR	P06213	1382 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	MEGF6	O75095	1541 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		12.58	□□□□□ -0.39
MLH1-222	ENST00000539477	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		12.58	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	PPP2R1A	P30153	589 aa		12.57	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		12.57	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	EYA1	Q99502	592 aa		12.57	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	SBF2	Q86WG5	1849 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	DISP2	A7MBM2	1401 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	HMOX1	P09601	288 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	UTRN	P46939	3433 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC184	Q52MB2	194 aa		12.52	□□□□□ -0.4
MLH1-222	ENST00000539477	IL2RB	P14784	551 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MLH1-222	ENST00000539477	IL13	P35225	146 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MLH1-222	ENST00000539477	DDB1	Q16531	1140 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MLH1-222	ENST00000539477	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MLH1-222	ENST00000539477	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MLH1-222	ENST00000539477	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MLH1-222	ENST00000539477	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MLH1-222	ENST00000539477	TNS2	Q63HR2	1409 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MLH1-222	ENST00000539477	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MLH1-222	ENST00000539477	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
MLH1-222	ENST00000539477	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41

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