RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504398.1

AC008825.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC008825.1, Length 452 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008825.1-201ENST00000504398 EVA1CP58658 441 aa25.14■■□□□ 1.62
AC008825.1-201ENST00000504398 FLT4P35916 1363 aa25.14■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.14■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.13■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.13■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.12■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 COL18A1P39060 1754 aa25.11■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.11■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.11■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 INSRP06213 1382 aa25.1■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 VPS72Q15906 364 aa25.1■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 LTN1O94822 1766 aa25.09■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 MTHFSP49914 203 aa25.08■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.08■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.07■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 PPP2R1AP30153 589 aa25.07■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 ERBB3P21860 1342 aa25.07■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.06■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 STRN4Q9NRL3 753 aa25.06■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 ATRNO75882 1429 aa25.05■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.05■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.04■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 ANP32CO43423 234 aa25.03■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.03■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 CFAP53Q96M91 514 aa25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 NRAPQ86VF7 1730 aa25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 CRB1P82279 1406 aa25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.01■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 PEAK1Q9H792 1746 aa25■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 RXRBP28702 533 aa24.99■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.99■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 POTEAQ6S8J7 498 aa24.98■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.98■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 BARGINQ6ZT62 677 aa24.97■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.97■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 RGPD5Q99666 1765 aa24.97■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 IL13P35225 146 aa24.94■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.92■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 NBPF4Q96M43 638 aa24.92■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 NUDCQ9Y266 331 aa24.92■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 EYA1Q99502 592 aa24.91■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 USP35Q9P2H5 1018 aa24.9■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.88■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 NCAPD2Q15021 1401 aa24.88■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 GLI3P10071 1580 aa24.88■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.86■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 IL2RBP14784 551 aa24.86■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.84■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 KDRP35968 1356 aa24.82■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 DISP2A7MBM2 1401 aa24.82■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.82■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 EXOC5O00471 708 aa24.8■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.8■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.79■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 A0A0G2JS52 829 aa24.78■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 FCHSD2O94868 740 aa24.78■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 MYT1Q01538 1121 aa24.78■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 DDB1Q16531 1140 aa24.78■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.77■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.77■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.76■■□□□ 1.55
AC008825.1-201ENST00000504398 PDE3BQ13370 1112 aa24.75■■□□□ 1.55
AC008825.1-201ENST00000504398 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.75■■□□□ 1.55
AC008825.1-201ENST00000504398 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
AC008825.1-201ENST00000504398 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.75■■□□□ 1.55
AC008825.1-201ENST00000504398 RGS12O14924 1447 aa24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms