RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482269.1

TTLL3-227, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 882 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-227ENST00000482269 FBLN1P23142 703 aa24.27■■□□□ 1.48
TTLL3-227ENST00000482269 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TTLL3-227ENST00000482269 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 ATRNO75882 1429 aa24.26■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 AMPHP49418 695 aa24.25■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 EVA1CP58658 441 aa24.25■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 RTL1A6NKG5 1358 aa24.25■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 VPS72Q15906 364 aa24.24■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 POTEAQ6S8J7 498 aa24.24■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 IP6K1Q92551 441 aa24.24■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.24■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.24■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 STRN4Q9NRL3 753 aa24.23■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 HOXC9P31274 260 aa24.21■■□□□ 1.47
TTLL3-227ENST00000482269 FLT4P35916 1363 aa24.2■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 POLKQ9UBT6 870 aa24.2■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 PEAK1Q9H792 1746 aa24.19■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 RXRBP28702 533 aa24.19■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.19■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.17■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 ERBB3P21860 1342 aa24.16■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.16■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.16■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.16■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.16■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 INSRP06213 1382 aa24.16■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 CRB1P82279 1406 aa24.15■■□□□ 1.46
TTLL3-227ENST00000482269 GLI3P10071 1580 aa24.14■■□□□ 1.45
TTLL3-227ENST00000482269 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.14■■□□□ 1.45
TTLL3-227ENST00000482269 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.14■■□□□ 1.45
TTLL3-227ENST00000482269 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TTLL3-227ENST00000482269 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.13■■□□□ 1.45
TTLL3-227ENST00000482269 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TTLL3-227ENST00000482269 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TTLL3-227ENST00000482269 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.11■■□□□ 1.45
TTLL3-227ENST00000482269 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.1■■□□□ 1.45
TTLL3-227ENST00000482269 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TTLL3-227ENST00000482269 MTHFSP49914 203 aa24.09■■□□□ 1.45
TTLL3-227ENST00000482269 RALBP1Q15311 655 aa24.09■■□□□ 1.45
TTLL3-227ENST00000482269 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.09■■□□□ 1.45
TTLL3-227ENST00000482269 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.09■■□□□ 1.45
TTLL3-227ENST00000482269 USP35Q9P2H5 1018 aa24.09■■□□□ 1.45
TTLL3-227ENST00000482269 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TTLL3-227ENST00000482269 BARGINQ6ZT62 677 aa24.07■■□□□ 1.44
TTLL3-227ENST00000482269 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.06■■□□□ 1.44
TTLL3-227ENST00000482269 PPP2R1AP30153 589 aa24.06■■□□□ 1.44
TTLL3-227ENST00000482269 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
TTLL3-227ENST00000482269 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.03■■□□□ 1.44
TTLL3-227ENST00000482269 RGS12O14924 1447 aa24.03■■□□□ 1.44
TTLL3-227ENST00000482269 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
TTLL3-227ENST00000482269 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
TTLL3-227ENST00000482269 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.02■■□□□ 1.44
TTLL3-227ENST00000482269 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.01■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.01■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 NBPF4Q96M43 638 aa24.01■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 A0A0G2JS52 829 aa24■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 MYT1Q01538 1121 aa24■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 CFAP53Q96M91 514 aa24■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 ILDR2Q71H61 639 aa23.98■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.98■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 DISP2A7MBM2 1401 aa23.97■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 IL13P35225 146 aa23.97■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 EYA1Q99502 592 aa23.97■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 NCAPD2Q15021 1401 aa23.96■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 IL2RBP14784 551 aa23.96■■□□□ 1.43
TTLL3-227ENST00000482269 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.95■■□□□ 1.42
TTLL3-227ENST00000482269 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.94■■□□□ 1.42
TTLL3-227ENST00000482269 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.94■■□□□ 1.42
TTLL3-227ENST00000482269 ANP32CO43423 234 aa23.93■■□□□ 1.42
TTLL3-227ENST00000482269 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.92■■□□□ 1.42
TTLL3-227ENST00000482269 LRRC37A3O60309 1634 aa23.92■■□□□ 1.42
TTLL3-227ENST00000482269 DDB1Q16531 1140 aa23.91■■□□□ 1.42
TTLL3-227ENST00000482269 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.91■■□□□ 1.42
TTLL3-227ENST00000482269 EXOC5O00471 708 aa23.9■■□□□ 1.42
TTLL3-227ENST00000482269 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TTLL3-227ENST00000482269 PDE3BQ13370 1112 aa23.89■■□□□ 1.41
TTLL3-227ENST00000482269 NUDCQ9Y266 331 aa23.89■■□□□ 1.41
TTLL3-227ENST00000482269 MEGF6O75095 1541 aa23.89■■□□□ 1.41
TTLL3-227ENST00000482269 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.88■■□□□ 1.41
TTLL3-227ENST00000482269 TNS2Q63HR2 1409 aa23.87■■□□□ 1.41
TTLL3-227ENST00000482269 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.87■■□□□ 1.41
TTLL3-227ENST00000482269 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
TTLL3-227ENST00000482269 KDRP35968 1356 aa23.86■■□□□ 1.41
TTLL3-227ENST00000482269 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms