RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 NRAPQ86VF7 1730 aa28.06■■■□□ 2.08
PMS1-211ENST00000424766 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
PMS1-211ENST00000424766 IP6K1Q92551 441 aa28.06■■■□□ 2.08
PMS1-211ENST00000424766 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
PMS1-211ENST00000424766 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.06■■■□□ 2.08
PMS1-211ENST00000424766 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PMS1-211ENST00000424766 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.04■■■□□ 2.08
PMS1-211ENST00000424766 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PMS1-211ENST00000424766 AMPHP49418 695 aa28.04■■■□□ 2.08
PMS1-211ENST00000424766 EVA1CP58658 441 aa28.04■■■□□ 2.08
PMS1-211ENST00000424766 VPS72Q15906 364 aa28.02■■■□□ 2.08
PMS1-211ENST00000424766 POLKQ9UBT6 870 aa28.02■■■□□ 2.08
PMS1-211ENST00000424766 ATRNO75882 1429 aa28.01■■■□□ 2.08
PMS1-211ENST00000424766 RTL1A6NKG5 1358 aa28.01■■■□□ 2.07
PMS1-211ENST00000424766 POTEAQ6S8J7 498 aa28.01■■■□□ 2.07
PMS1-211ENST00000424766 HOXC9P31274 260 aa28■■■□□ 2.07
PMS1-211ENST00000424766 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28■■■□□ 2.07
PMS1-211ENST00000424766 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
PMS1-211ENST00000424766 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
PMS1-211ENST00000424766 STRN4Q9NRL3 753 aa27.99■■■□□ 2.07
PMS1-211ENST00000424766 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
PMS1-211ENST00000424766 PEAK1Q9H792 1746 aa27.97■■■□□ 2.07
PMS1-211ENST00000424766 FLT4P35916 1363 aa27.97■■■□□ 2.07
PMS1-211ENST00000424766 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
PMS1-211ENST00000424766 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.94■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 RXRBP28702 533 aa27.94■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 INSRP06213 1382 aa27.94■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 ERBB3P21860 1342 aa27.93■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.93■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.93■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.93■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.92■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.92■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 CRB1P82279 1406 aa27.91■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.91■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.9■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 MTHFSP49914 203 aa27.9■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.9■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 RALBP1Q15311 655 aa27.89■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
PMS1-211ENST00000424766 GLI3P10071 1580 aa27.88■■■□□ 2.05
PMS1-211ENST00000424766 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.88■■■□□ 2.05
PMS1-211ENST00000424766 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
PMS1-211ENST00000424766 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
PMS1-211ENST00000424766 PPP2R1AP30153 589 aa27.86■■■□□ 2.05
PMS1-211ENST00000424766 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
PMS1-211ENST00000424766 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.85■■■□□ 2.05
PMS1-211ENST00000424766 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.85■■■□□ 2.05
PMS1-211ENST00000424766 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.84■■■□□ 2.05
PMS1-211ENST00000424766 BARGINQ6ZT62 677 aa27.83■■■□□ 2.05
PMS1-211ENST00000424766 USP35Q9P2H5 1018 aa27.83■■■□□ 2.05
PMS1-211ENST00000424766 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
PMS1-211ENST00000424766 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
PMS1-211ENST00000424766 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
PMS1-211ENST00000424766 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.79■■■□□ 2.04
PMS1-211ENST00000424766 NBPF4Q96M43 638 aa27.79■■■□□ 2.04
PMS1-211ENST00000424766 CFAP53Q96M91 514 aa27.77■■■□□ 2.04
PMS1-211ENST00000424766 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 IL13P35225 146 aa27.75■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.75■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 EYA1Q99502 592 aa27.75■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.75■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.74■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 RGS12O14924 1447 aa27.73■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 ANP32CO43423 234 aa27.71■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 IL2RBP14784 551 aa27.71■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 NCAPD2Q15021 1401 aa27.71■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.71■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 DISP2A7MBM2 1401 aa27.7■■■□□ 2.03
PMS1-211ENST00000424766 A0A0G2JS52 829 aa27.7■■■□□ 2.02
PMS1-211ENST00000424766 MYT1Q01538 1121 aa27.7■■■□□ 2.02
PMS1-211ENST00000424766 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.69■■■□□ 2.02
PMS1-211ENST00000424766 ILDR2Q71H61 639 aa27.69■■■□□ 2.02
PMS1-211ENST00000424766 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.69■■■□□ 2.02
PMS1-211ENST00000424766 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.68■■■□□ 2.02
PMS1-211ENST00000424766 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.66■■■□□ 2.02
PMS1-211ENST00000424766 NUDCQ9Y266 331 aa27.66■■■□□ 2.02
PMS1-211ENST00000424766 EXOC5O00471 708 aa27.65■■■□□ 2.02
PMS1-211ENST00000424766 DDB1Q16531 1140 aa27.64■■■□□ 2.02
PMS1-211ENST00000424766 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
PMS1-211ENST00000424766 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.63■■■□□ 2.01
PMS1-211ENST00000424766 PDE3BQ13370 1112 aa27.62■■■□□ 2.01
PMS1-211ENST00000424766 LRRC37A3O60309 1634 aa27.61■■■□□ 2.01
PMS1-211ENST00000424766 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.61■■■□□ 2.01
PMS1-211ENST00000424766 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
PMS1-211ENST00000424766 MEGF6O75095 1541 aa27.6■■■□□ 2.01
PMS1-211ENST00000424766 KDRP35968 1356 aa27.6■■■□□ 2.01
PMS1-211ENST00000424766 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.59■■■□□ 2.01
PMS1-211ENST00000424766 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.59■■■□□ 2.01
PMS1-211ENST00000424766 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
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