RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD12-202ENST00000406506 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXD12-202ENST00000406506 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
HOXD12-202ENST00000406506 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 RXRBP28702 533 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 FBLN1P23142 703 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 STRN4Q9NRL3 753 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 RGS12O14924 1447 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 RTL1A6NKG5 1358 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
HOXD12-202ENST00000406506 CRB1P82279 1406 aa26.39■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 EVA1CP58658 441 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 IP6K1Q92551 441 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 HOXC9P31274 260 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 ERBB3P21860 1342 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 FLT4P35916 1363 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 AMPHP49418 695 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 MORC1Q86VD1 984 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
HOXD12-202ENST00000406506 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
HOXD12-202ENST00000406506 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
HOXD12-202ENST00000406506 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXD12-202ENST00000406506 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD12-202ENST00000406506 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD12-202ENST00000406506 USP35Q9P2H5 1018 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD12-202ENST00000406506 INSRP06213 1382 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXD12-202ENST00000406506 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
HOXD12-202ENST00000406506 POLKQ9UBT6 870 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXD12-202ENST00000406506 LRRC37A3O60309 1634 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD12-202ENST00000406506 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXD12-202ENST00000406506 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD12-202ENST00000406506 EP400Q96L91 3159 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD12-202ENST00000406506 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXD12-202ENST00000406506 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD12-202ENST00000406506 BARGINQ6ZT62 677 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD12-202ENST00000406506 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXD12-202ENST00000406506 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXD12-202ENST00000406506 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXD12-202ENST00000406506 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD12-202ENST00000406506 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD12-202ENST00000406506 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD12-202ENST00000406506 DISP2A7MBM2 1401 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD12-202ENST00000406506 A0A0G2JS52 829 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD12-202ENST00000406506 MYT1Q01538 1121 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD12-202ENST00000406506 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD12-202ENST00000406506 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXD12-202ENST00000406506 NCAPD2Q15021 1401 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXD12-202ENST00000406506 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXD12-202ENST00000406506 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXD12-202ENST00000406506 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 NBPF4Q96M43 638 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 TNS2Q63HR2 1409 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 MTHFSP49914 203 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 MEGF6O75095 1541 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 SOCS7O14512 581 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 IL2RBP14784 551 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 PPP2R1AP30153 589 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 DDB1Q16531 1140 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 SBF2Q86WG5 1849 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD12-202ENST00000406506 EYA1Q99502 592 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD12-202ENST00000406506 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD12-202ENST00000406506 PDE3BQ13370 1112 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD12-202ENST00000406506 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXD12-202ENST00000406506 IL13P35225 146 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD12-202ENST00000406506 FAM182BQ5T319 152 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD12-202ENST00000406506 RALBP1Q15311 655 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD12-202ENST00000406506 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD12-202ENST00000406506 EXOC5O00471 708 aa26■■□□□ 1.75
HOXD12-202ENST00000406506 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
HOXD12-202ENST00000406506 KDRP35968 1356 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD12-202ENST00000406506 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
HOXD12-202ENST00000406506 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
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