RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395564.8

UPP1-203, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-203ENST00000395564 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 IP6K1Q92551 441 aa24.46■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
UPP1-203ENST00000395564 AMPHP49418 695 aa24.45■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.44■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 ATRNO75882 1429 aa24.43■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 POLKQ9UBT6 870 aa24.43■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 FLT4P35916 1363 aa24.43■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 HOXC9P31274 260 aa24.42■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 VPS72Q15906 364 aa24.42■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 EVA1CP58658 441 aa24.42■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.42■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 RGPD5Q99666 1765 aa24.4■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 PEAK1Q9H792 1746 aa24.4■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 INSRP06213 1382 aa24.39■■□□□ 1.5
UPP1-203ENST00000395564 STRN4Q9NRL3 753 aa24.39■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 ERBB3P21860 1342 aa24.39■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 RALBP1Q15311 655 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 POTEAQ6S8J7 498 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.36■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 CRB1P82279 1406 aa24.36■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.33■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 MTHFSP49914 203 aa24.33■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
UPP1-203ENST00000395564 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.32■■□□□ 1.48
UPP1-203ENST00000395564 RXRBP28702 533 aa24.32■■□□□ 1.48
UPP1-203ENST00000395564 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.32■■□□□ 1.48
UPP1-203ENST00000395564 GLI3P10071 1580 aa24.31■■□□□ 1.48
UPP1-203ENST00000395564 PPP2R1AP30153 589 aa24.31■■□□□ 1.48
UPP1-203ENST00000395564 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.31■■□□□ 1.48
UPP1-203ENST00000395564 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
UPP1-203ENST00000395564 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
UPP1-203ENST00000395564 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
UPP1-203ENST00000395564 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.28■■□□□ 1.48
UPP1-203ENST00000395564 BARGINQ6ZT62 677 aa24.27■■□□□ 1.48
UPP1-203ENST00000395564 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.27■■□□□ 1.48
UPP1-203ENST00000395564 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
UPP1-203ENST00000395564 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
UPP1-203ENST00000395564 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
UPP1-203ENST00000395564 USP35Q9P2H5 1018 aa24.25■■□□□ 1.47
UPP1-203ENST00000395564 CFAP53Q96M91 514 aa24.24■■□□□ 1.47
UPP1-203ENST00000395564 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-203ENST00000395564 NBPF4Q96M43 638 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-203ENST00000395564 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
UPP1-203ENST00000395564 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
UPP1-203ENST00000395564 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-203ENST00000395564 ANP32CO43423 234 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-203ENST00000395564 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
UPP1-203ENST00000395564 NCAPD2Q15021 1401 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-203ENST00000395564 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
UPP1-203ENST00000395564 IL13P35225 146 aa24.2■■□□□ 1.46
UPP1-203ENST00000395564 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.2■■□□□ 1.46
UPP1-203ENST00000395564 EYA1Q99502 592 aa24.19■■□□□ 1.46
UPP1-203ENST00000395564 DISP2A7MBM2 1401 aa24.18■■□□□ 1.46
UPP1-203ENST00000395564 RGS12O14924 1447 aa24.18■■□□□ 1.46
UPP1-203ENST00000395564 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.18■■□□□ 1.46
UPP1-203ENST00000395564 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.18■■□□□ 1.46
UPP1-203ENST00000395564 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.17■■□□□ 1.46
UPP1-203ENST00000395564 IL2RBP14784 551 aa24.16■■□□□ 1.46
UPP1-203ENST00000395564 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.16■■□□□ 1.46
UPP1-203ENST00000395564 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
UPP1-203ENST00000395564 A0A0G2JS52 829 aa24.14■■□□□ 1.45
UPP1-203ENST00000395564 MYT1Q01538 1121 aa24.14■■□□□ 1.45
UPP1-203ENST00000395564 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.14■■□□□ 1.45
UPP1-203ENST00000395564 NUDCQ9Y266 331 aa24.14■■□□□ 1.45
UPP1-203ENST00000395564 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.14■■□□□ 1.45
UPP1-203ENST00000395564 KDRP35968 1356 aa24.12■■□□□ 1.45
UPP1-203ENST00000395564 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.12■■□□□ 1.45
UPP1-203ENST00000395564 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
UPP1-203ENST00000395564 DDB1Q16531 1140 aa24.1■■□□□ 1.45
UPP1-203ENST00000395564 LRRC37A3O60309 1634 aa24.1■■□□□ 1.45
UPP1-203ENST00000395564 MEGF6O75095 1541 aa24.09■■□□□ 1.45
UPP1-203ENST00000395564 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.09■■□□□ 1.45
UPP1-203ENST00000395564 EXOC5O00471 708 aa24.08■■□□□ 1.45
UPP1-203ENST00000395564 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.08■■□□□ 1.45
UPP1-203ENST00000395564 TNS2Q63HR2 1409 aa24.08■■□□□ 1.44
UPP1-203ENST00000395564 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.07■■□□□ 1.44
UPP1-203ENST00000395564 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
UPP1-203ENST00000395564 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
UPP1-203ENST00000395564 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.07■■□□□ 1.44
UPP1-203ENST00000395564 PDE3BQ13370 1112 aa24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms