RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.8■■■□□ 2.36
SLC25A39-201ENST00000225308 GLI3P10071 1580 aa29.8■■■□□ 2.36
SLC25A39-201ENST00000225308 VPS72Q15906 364 aa29.79■■■□□ 2.36
SLC25A39-201ENST00000225308 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
SLC25A39-201ENST00000225308 STRN4Q9NRL3 753 aa29.77■■■□□ 2.36
SLC25A39-201ENST00000225308 PEAK1Q9H792 1746 aa29.77■■■□□ 2.36
SLC25A39-201ENST00000225308 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.76■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 RXRBP28702 533 aa29.75■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 ILDR2Q71H61 639 aa29.74■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 RTL1A6NKG5 1358 aa29.73■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 EVA1CP58658 441 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 IP6K1Q92551 441 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 MORC1Q86VD1 984 aa29.71■■■□□ 2.35
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SLC25A39-201ENST00000225308 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 HOXC9P31274 260 aa29.71■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
SLC25A39-201ENST00000225308 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.7■■■□□ 2.34
SLC25A39-201ENST00000225308 ERBB3P21860 1342 aa29.69■■■□□ 2.34
SLC25A39-201ENST00000225308 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.69■■■□□ 2.34
SLC25A39-201ENST00000225308 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.69■■■□□ 2.34
SLC25A39-201ENST00000225308 AMPHP49418 695 aa29.69■■■□□ 2.34
SLC25A39-201ENST00000225308 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
SLC25A39-201ENST00000225308 CRB1P82279 1406 aa29.68■■■□□ 2.34
SLC25A39-201ENST00000225308 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.68■■■□□ 2.34
SLC25A39-201ENST00000225308 RGS12O14924 1447 aa29.67■■■□□ 2.34
SLC25A39-201ENST00000225308 POLKQ9UBT6 870 aa29.67■■■□□ 2.34
SLC25A39-201ENST00000225308 FLT4P35916 1363 aa29.67■■■□□ 2.34
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
SLC25A39-201ENST00000225308 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.63■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 USP35Q9P2H5 1018 aa29.63■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.63■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.63■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.63■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 EP400Q96L91 3159 aa29.62■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.62■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 INSRP06213 1382 aa29.62■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.62■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 WNK3Q9BYP7 1800 aa29.61■■■□□ 2.33
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SLC25A39-201ENST00000225308 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.6■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.59■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.58■■■□□ 2.33
SLC25A39-201ENST00000225308 BARGINQ6ZT62 677 aa29.56■■■□□ 2.32
SLC25A39-201ENST00000225308 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
SLC25A39-201ENST00000225308 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.55■■■□□ 2.32
SLC25A39-201ENST00000225308 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.54■■■□□ 2.32
SLC25A39-201ENST00000225308 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
SLC25A39-201ENST00000225308 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.51■■■□□ 2.31
SLC25A39-201ENST00000225308 MTHFSP49914 203 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC25A39-201ENST00000225308 DISP2A7MBM2 1401 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A0G2JS52 829 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC25A39-201ENST00000225308 MYT1Q01538 1121 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC25A39-201ENST00000225308 LRRC37A3O60309 1634 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC25A39-201ENST00000225308 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC25A39-201ENST00000225308 NBPF4Q96M43 638 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC25A39-201ENST00000225308 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SLC25A39-201ENST00000225308 NCAPD2Q15021 1401 aa29.44■■■□□ 2.3
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP2R1AP30153 589 aa29.44■■■□□ 2.3
SLC25A39-201ENST00000225308 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.43■■■□□ 2.3
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SLC25A39-201ENST00000225308 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SLC25A39-201ENST00000225308 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.42■■■□□ 2.3
SLC25A39-201ENST00000225308 EYA1Q99502 592 aa29.41■■■□□ 2.3
SLC25A39-201ENST00000225308 IL2RBP14784 551 aa29.4■■■□□ 2.3
SLC25A39-201ENST00000225308 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.4■■■□□ 2.3
SLC25A39-201ENST00000225308 MEGF6O75095 1541 aa29.39■■■□□ 2.3
SLC25A39-201ENST00000225308 TNS2Q63HR2 1409 aa29.37■■■□□ 2.29
SLC25A39-201ENST00000225308 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.37■■■□□ 2.29
SLC25A39-201ENST00000225308 IL13P35225 146 aa29.37■■■□□ 2.29
SLC25A39-201ENST00000225308 RALBP1Q15311 655 aa29.37■■■□□ 2.29
SLC25A39-201ENST00000225308 DDB1Q16531 1140 aa29.36■■■□□ 2.29
SLC25A39-201ENST00000225308 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.34■■■□□ 2.29
SLC25A39-201ENST00000225308 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.34■■■□□ 2.29
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM182BQ5T319 152 aa29.33■■■□□ 2.29
SLC25A39-201ENST00000225308 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
SLC25A39-201ENST00000225308 PDE3BQ13370 1112 aa29.32■■■□□ 2.28
SLC25A39-201ENST00000225308 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
SLC25A39-201ENST00000225308 EXOC5O00471 708 aa29.31■■■□□ 2.28
SLC25A39-201ENST00000225308 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.31■■■□□ 2.28
SLC25A39-201ENST00000225308 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.3■■■□□ 2.28
SLC25A39-201ENST00000225308 KDRP35968 1356 aa29.29■■■□□ 2.28
SLC25A39-201ENST00000225308 SOCS7O14512 581 aa29.29■■■□□ 2.28
SLC25A39-201ENST00000225308 CFAP53Q96M91 514 aa29.28■■■□□ 2.28
SLC25A39-201ENST00000225308 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
SLC25A39-201ENST00000225308 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
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