RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278833.3

ROM1-201, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ROM1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-201ENST00000278833 EPHA3P29320 983 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 NUDT2P50583 147 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 RENBPP51606 427 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 CLCN2P51788 898 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 LPIN1Q14693 890 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 MON1AQ86VX9 555 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 PELI3Q8N2H9 469 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 TEX26Q8N6G2 289 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 C8orf48Q96LL4 319 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 TMEM248Q9NWD8 314 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 PMPCBO75439 489 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 RAG1P15918 1043 aa25.26■■□□□ 1.63
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ROM1-201ENST00000278833 ZNF423Q2M1K9 1284 aa25.26■■□□□ 1.63
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ROM1-201ENST00000278833 CHSY3Q70JA7 882 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 C14orf80Q86SX3 495 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 HEXDCQ8WVB3 486 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 DLG3Q92796 817 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 OMDQ99983 421 aa25.26■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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ROM1-201ENST00000278833 SLC7A4O43246 635 aa25.25■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 ZMPSTE24O75844 475 aa25.25■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 FESP07332 822 aa25.25■■□□□ 1.63
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ROM1-201ENST00000278833 GRIK1P39086 918 aa25.25■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 PSMD8P48556 350 aa25.25■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 SLC12A2P55011 1212 aa25.25■■□□□ 1.63
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ROM1-201ENST00000278833 PEX6Q13608 980 aa25.25■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 FAM83EQ2M2I3 478 aa25.25■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 PIK3R6Q5UE93 754 aa25.25■■□□□ 1.63
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ROM1-201ENST00000278833 GDPD5Q8WTR4 605 aa25.25■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 HACD3Q9P035 362 aa25.25■■□□□ 1.63
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ROM1-201ENST00000278833 CCDC78A2IDD5 438 aa25.24■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 AHCYL1O43865 530 aa25.24■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 ADAMTS4O75173 837 aa25.24■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 OAZ2O95190 189 aa25.24■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 RBP1P09455 135 aa25.24■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 SAT1P21673 171 aa25.24■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 THPOP40225 353 aa25.24■■□□□ 1.63
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ROM1-201ENST00000278833 MROH6A6NGR9 719 aa25.23■■□□□ 1.63
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ROM1-201ENST00000278833 GRM2Q14416 872 aa25.23■■□□□ 1.63
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ROM1-201ENST00000278833 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
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ROM1-201ENST00000278833 MAGEA11P43364 429 aa25.22■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 SULT2A1Q06520 285 aa25.22■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 DSC1Q08554 894 aa25.22■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 ACAP2Q15057 778 aa25.22■■□□□ 1.63
ROM1-201ENST00000278833 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
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