RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	NFS1	Q9Y697	457 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PRRT4	C9JH25	899 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529		K7ERQ8	282 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM24	O15164	1050 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SOCS5	O75159	536 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	AVIL	O75366	819 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PMPCB	O75439	489 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	NDST3	O95803	873 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	AGT	P01019	485 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PRL	P01236	227 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	FGF1	P05230	155 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	C7	P10643	843 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ELK3	P41970	407 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	RAD51	Q06609	339 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ENPP2	Q13822	863 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC29A2	Q14542	456 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	DLG2	Q15700	870 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	BBS9	Q3SYG4	887 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	CARD16	Q5EG05	197 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PCID2	Q5JVF3	399 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC25	Q86WR0	208 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PALM2	Q8IXS6	379 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	UCMA	Q8WVF2	138 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	DCX	O43602	365 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SASH3	O75995	380 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	KAT7	O95251	611 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	IGSF6	O95976	241 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PGAM1	P18669	254 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	COL9A1	P20849	921 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ADRA1D	P25100	572 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PHB	P35232	272 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	GALK1	P51570	392 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	GPX6	P59796	221 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PFKP	Q01813	784 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SPARCL1	Q14515	664 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	STAT4	Q14765	748 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	DENND2C	Q68D51	928 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	IPMK	Q8NFU5	416 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	C9orf72	Q96LT7	481 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	FICD	Q9BVA6	458 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM245	Q9H330	911 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	UBP1	Q9NZI7	540 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	SOX13	Q9UN79	622 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR37L1	O60883	481 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	USP1	O94782	785 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	APOD	P05090	189 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	ST8SIA6	P61647	398 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms