RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 A0A0U1RQF3 1178 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 DYTNA2CJ06 578 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 USP17L23D6RBM5 183 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SNAP23O00161 211 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 AP3D1O14617 1153 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 MDM4O15151 490 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 LIASO43766 372 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 PCNAP12004 261 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 ALOX12P18054 663 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SRD5A1P18405 259 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 KELP23276 732 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 NFKBIAP25963 317 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 CD38P28907 300 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 CDAP32320 146 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 DCTDP32321 178 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 HOXD13P35453 343 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 CXCR3P49682 368 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 GNAQP50148 359 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 TMPRSS3P57727 454 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 FGFBP1Q14512 234 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 PPP2R5BQ15173 497 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 DPCR1Q3MIW9 517 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 MORN5Q5VZ52 161 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 TTI2Q6NXR4 508 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 PIP4P1Q86T03 277 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 LURAP1LQ8IV03 231 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 DENND6AQ8IWF6 608 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 FAM217AQ8IXS0 508 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 PDILTQ8N807 584 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 GJC3Q8NFK1 279 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 CEP76Q8TAP6 659 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 BICD2Q8TD16 824 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 PIGOQ8TEQ8 1089 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 GTF3C6Q969F1 213 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SMARCE1Q969G3 411 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF333Q96JL9 665 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 ZFYVE19Q96K21 471 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 YME1L1Q96TA2 773 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 TASP1Q9H6P5 420 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 NRIP3Q9NQ35 241 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SLC6A13Q9NSD5 602 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 HAUS2Q9NVX0 235 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 EHD2Q9NZN4 543 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 ABI3Q9P2A4 366 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 PTGFRNQ9P2B2 879 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 C11orf21Q9P2W6 132 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 HAO1Q9UJM8 370 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 VPS28Q9UK41 221 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 A0A1W2PRG0 241 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 AGAP14A8MT82 685 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 KLRF2D3W0D1 207 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 IFNA2P01563 188 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 KLKB1P03952 638 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 AVPR1AP37288 418 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 PPP3CCP48454 512 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 CLCN5P51795 746 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 FAM27E3Q08E93 113 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 GRIK3Q13003 919 aa3.26□□□□□ -1.89
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