RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598902.5

LINC01515-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1515, human

TSL 5

Gene LINC01515, Length 778 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01515-208	ENST00000598902	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	SYT5	O00445	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	METTL18	O95568	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	ACP5	P13686	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	PPM1A	P35813	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	MTNR1A	P48039	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	CENPA	P49450	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	MVD	P53602	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	P2RY10	O00398	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	EDIL3	O43854	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	SSTR2	P30874	369 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	TAF6	P49848	677 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01515-208	ENST00000598902	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	FAM72C	H0Y354	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902		J3KR12	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	WNT9B	O14905	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	CRYAA	P02489	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	CTPS1	P17812	591 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	PNPLA4	P41247	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	FAM72B	Q86X60	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902		A0A1B0GVY2	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	CDKN1A	P38936	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	MCM2	P49736	904 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	ZNF132	P52740	706 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	PICALM	Q13492	652 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	NCSTN	Q92542	709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	SEPT4	O43236	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	CBX6	O95503	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	RNF224	P0DH78	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	MCM3	P25205	808 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	LIFR	P42702	1097 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	NLRP5	P59047	1200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	TNFAIP1	Q13829	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	SRL	Q86TD4	932 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	RNF183	Q96D59	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	FGF17	O60258	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	ZG16	O60844	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	KDM4B	O94953	1096 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	IL1A	P01583	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	TTK	P33981	857 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	SERPINF1	P36955	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01515-208	ENST00000598902	GNAL	P38405	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms