RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554186.1

LINC00520-201, long intergenic non-protein coding RNA 520, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00520, Length 831 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00520-201ENST00000554186 CAVIN2O95810 425 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 TIMP1P01033 207 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 KCNE1P15382 129 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CSF2RAP15509 400 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 TMOD1P28289 359 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 PTPN7P35236 360 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 ID4P47928 161 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 GCLMP48507 274 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 FMO5P49326 533 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 LIG4P49917 911 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 VAMP7P51809 220 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 PER3P56645 1201 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 UBASH3AP57075 661 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 DEFB103AP81534 67 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 TFDP1Q14186 410 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 SYCP1Q15431 976 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 TMEM95Q3KNT9 176 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 TMEM240Q5SV17 173 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 JADE1Q6IE81 842 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CATSPER4Q7RTX7 472 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 NECAB2Q7Z6G3 386 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF280BQ86YH2 543 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 GPR156Q8NFN8 814 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 POMGNT1Q8WZA1 660 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 SNX27Q96L92 541 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CASD1Q96PB1 797 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 MAP7D2Q96T17 732 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CRACR2AQ9BSW2 395 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 MSTO1Q9BUK6 570 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 VN1R3Q9BXE9 311 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 PRO3102Q9H379 93 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 BCO1Q9HAY6 547 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 ACP6Q9NPH0 428 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 KCTD5Q9NXV2 234 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 LZTS1Q9Y250 596 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.55□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 SZT2Q5T011 3432 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 BICDL2A1A5D9 508 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 ARL5CA6NH57 179 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF233A6NK53 670 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 ALG1L2C9J202 215 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 PIRO00625 290 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF263O14978 683 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CETN3O15182 167 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 EXOC3O60645 756 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 HLA-DRAP01903 254 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CELA2AP08217 269 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CLTAP09496 248 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CLTBP09497 229 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 ELFN1P0C7U0 828 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 HARSP12081 509 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CHRNB2P17787 502 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CYP3A5P20815 502 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 SCP2P22307 547 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 AXLP30530 894 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 PPP1R2P41236 205 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 SLC5A3P53794 718 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 MYL6P60660 151 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CCZ1BP86790 482 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CDC42EP1Q00587 391 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 ENPEPQ07075 957 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 DSC1Q08554 894 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 LRMPQ12912 555 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 SP140Q13342 867 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 GLRA4Q5JXX5 417 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 C9orf50Q5SZB4 431 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 SLC27A1Q6PCB7 646 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 Q6ZVL8 140 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 DEFB128Q7Z7B8 93 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 PALB2Q86YC2 1186 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 DRC7Q8IY82 874 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 SYCP3Q8IZU3 236 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 SLC17A8Q8NDX2 589 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 OR7D4Q8NG98 312 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 BADQ92934 168 aa4.54□□□□□ -1.68
LINC00520-201ENST00000554186 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms