RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 ALG10Q5BKT4 473 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 SLC45A4Q5BKX6 768 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ALG10BQ5I7T1 473 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 TTC39AQ5SRH9 613 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 AAGABQ6PD74 315 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF793Q6ZN11 406 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 MOB3CQ70IA8 216 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 CPLX4Q7Z7G2 160 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 TADA2BQ86TJ2 420 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 FAM160B2Q86V87 743 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 IGFN1Q86VF2 1251 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 CNTROBQ8N137 903 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 NGEFQ8N5V2 710 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ZMIZ2Q8NF64 920 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 OR4N2Q8NGD1 307 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ETNPPLQ8TBG4 499 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 CREB3L4Q8TEY5 395 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 GDPD5Q8WTR4 605 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 SPAG4Q9NPE6 437 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 SNTG1Q9NSN8 517 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM45AQ9NWC5 275 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 PIAS3Q9Y6X2 628 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 A0A0G2JK05 382 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 FSD2A1L4K1 749 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 FAM157AC9JC47 383 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 E5RJQ4 531 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 SEC14L2O76054 403 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 LDHCP07864 332 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 UNGP13051 313 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 LAMP2P13473 410 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 POU1F1P28069 291 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ICAM3P32942 547 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 SLC16A2P36021 539 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 CPOXP36551 454 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 DPP6P42658 865 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 ID2Q02363 134 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 SLC18A2Q05940 514 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ASPHD1Q5U4P2 390 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 CFAP161Q6P656 301 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 FAM185AQ8N0U4 392 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ADSSL1Q8N142 457 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 SLC25A41Q8N5S1 370 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 DPP10Q8N608 796 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 TUBB6Q9BUF5 446 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 RNF146Q9NTX7 359 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 CDH22Q9UJ99 828 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 PSAT1Q9Y617 370 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 MASP2O00187 686 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 TAF4O00268 1085 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 RNMTO43148 476 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 PTP4A3O75365 173 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 CCNDBP1O95273 360 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 MLYCDO95822 493 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 HEXAP06865 529 aa3.31□□□□□ -1.88
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