RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	MTX1	Q13505	466 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TRPC3	Q13507	836 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	RABEP1	Q15276	862 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	NCSTN	Q92542	709 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	MROH8	Q9H579	483 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	COG5	Q9UP83	839 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334		A6NNC1	897 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	STRN	O43815	780 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	FGB	P02675	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	PRF1	P14222	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	HNF1B	P35680	557 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	PTPN9	P43378	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	MTNR1A	P48039	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TLE2	Q04725	743 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	GAD2	Q05329	585 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TDG	Q13569	410 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	PLK5	Q496M5	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334		A0A0A0MQY5	61 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334		A0A0G2JK05	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	EYA2	O00167	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	LCK	P06239	509 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	CHRNB1	P11230	501 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	GJC1	P36383	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	PGM1	P36871	562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ALF	Q53S48	1182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ESX1	Q8N693	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	HTRA1	Q92743	480 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-231	ENST00000477334	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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