RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	KIF12	Q96FN5	646 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	NUF2	Q9BZD4	464 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	CDT1	Q9H211	546 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	TLK1	Q9UKI8	766 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	SIPA1L1	O43166	1804 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	DNAJA2	O60884	412 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	POLB	P06746	335 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	NAT2	P11245	290 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	ITGAX	P20702	1163 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	GSS	P48637	474 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	NME3	Q13232	169 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	STIL	Q15468	1287 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	NRF1	Q16656	503 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	MBLAC2	Q68D91	279 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	PQLC3	Q8N755	202 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	TASP1	Q9H6P5	420 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	COPG2	Q9UBF2	871 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	KPNA7	A9QM74	516 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	AQP9	O43315	295 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	THRA	P10827	490 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	KLF10	Q13118	480 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	OLIG2	Q13516	323 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	DLG2	Q15700	870 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	DCAF15	Q66K64	600 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	KRT80	Q6KB66	452 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	PMF1	Q6P1K2	205 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	APBB2	Q92870	758 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	C1orf21	Q9H246	121 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	PADI4	Q9UM07	663 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	PPME1	Q9Y570	386 aa		11.58	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM159B	A6NKW6	160 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	CILP	O75339	1184 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	AMH	P03971	560 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	GOT1	P17174	413 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	CNTF	P26441	200 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	CPOX	P36551	454 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	AVPR1A	P37288	418 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC5A3	P53794	718 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	TTC39C	Q8N584	583 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	UBR7	Q8N806	425 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	RNF169	Q8NCN4	708 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	SGF29	Q96ES7	293 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	CTRC	Q99895	268 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	GID8	Q9NWU2	228 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157		A0A096LPK6	155 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	HMX2	A2RU54	273 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	ACKR2	O00590	384 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	PSMB4	P28070	264 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	PCLAF	Q15004	111 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	TRNP1	Q6NT89	227 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		11.57	□□□□□ -0.56
SSUH2-208	ENST00000455157	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56

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