RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 SCAIQ8N9R8 606 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 SETD9Q8NE22 299 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TNIP2Q8NFZ5 429 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 NFKBIDQ8NI38 313 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 HASPINQ8TF76 798 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 UCMAQ8WVF2 138 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 C5orf34Q96MH7 638 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 FRG2BQ96QU4 278 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 EPHX3Q9H6B9 360 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 HCN3Q9P1Z3 774 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 AASSQ9UDR5 926 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TNFSF13BQ9Y275 285 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM247A6NEH6 219 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 WIPF3A6NGB9 483 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 C2CD4BA6NLJ0 364 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TEX22C9J3V5 150 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 STRNO43815 780 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 DDX58O95786 925 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 LATS1O95835 1130 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 PRKCGP05129 697 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 URODP06132 367 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 FCGR2AP12318 317 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 CD72P21854 359 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 PTPN9P43378 593 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 CCR9P51686 369 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 EIF5P55010 431 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 SLC12A2P55011 1212 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 DCAF7P61962 342 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 HSF1Q00613 529 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 NHLH1Q02575 133 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 CFHR1Q03591 330 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 GALNT3Q14435 633 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 PLK5Q496M5 336 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 C5orf22Q49AR2 442 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 WDR78Q5VTH9 848 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 FAM171A1Q5VUB5 890 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 LRIG3Q6UXM1 1119 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 PTF1AQ7RTS3 328 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM217Q8N7C4 229 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 BCAS4Q8TDM0 211 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 ADAMTS15Q8TE58 950 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 KAT2AQ92830 837 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 USP44Q9H0E7 712 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 SLC25A18Q9H1K4 315 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 RIOX1Q9H6W3 641 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 VEZTQ9HBM0 779 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 SLC8A2Q9UPR5 921 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 A0A1W2PPH5 198 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 OR6C68A6NDL8 312 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 MSI1O43347 362 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TNFSF14O43557 240 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 NEURL1O76050 574 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 NFATC1O95644 943 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 DDAH2O95865 285 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 NUDT3O95989 172 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 WNT1P04628 370 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 CHRNA5P30532 468 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 EFNB1P98172 346 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 FOXF2Q12947 444 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 RPE65Q16518 533 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 FBXO43Q4G163 708 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF667Q5HYK9 610 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC30Q5VVM6 783 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 MZT2BQ6NZ67 158 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 C17orf99Q6UX52 265 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 RD3Q7Z3Z2 195 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 PRIMA1Q86XR5 153 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 GALNT16Q8N428 558 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 PLD5Q8N7P1 536 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 IGFBPL1Q8WX77 278 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 HSPH1Q92598 858 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 NELL1Q92832 810 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 MPHOSPH8Q99549 860 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 PIMREGQ9BSJ6 248 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms