RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520400.5

CTNNA1-222, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 4

Gene CTNNA1, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-222	ENST00000520400	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	SGPL1	O95470	568 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	METTL18	O95568	372 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	CYP4B1	P13584	511 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	ABCD3	P28288	659 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	VAMP2	P63027	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	PKP1	Q13835	747 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	ADAM10	O14672	748 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	BCAR3	O75815	825 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	NEURL1	O76050	574 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	FOXF2	Q12947	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	GPR162	Q16538	588 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	EME1	Q96AY2	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTNNA1-222	ENST00000520400		A0A0G2JK05	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400		A0A1W2PPC1	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	PPP6C	O00743	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	ANP32C	O43423	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TSPAN3	O60637	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TBX18	O95935	607 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TUBB4A	P04350	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	UROD	P06132	367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	FCGR2A	P12318	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	EPHB2	P29323	1055 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	MIDN	Q504T8	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	PER2	O15055	1255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	UGDH	O60701	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	GSTM2	P28161	218 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	GJC1	P36383	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	PGM1	P36871	562 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	EFNA5	P52803	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	NFIL3	Q16649	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	EYA3	Q99504	573 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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