RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 TMEM51Q9NW97 253 aa27.62■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 CEACAM1P13688 526 aa27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 RAPGEF1Q13905 1077 aa27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 TAF5Q15542 800 aa27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 UAP1L1Q3KQV9 507 aa27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 RAP1GAP2Q684P5 730 aa27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 OR6B2Q6IFH4 312 aa27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 SLC26A9Q7LBE3 791 aa27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 TMEM35BQ8NCS4 154 aa27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 PDCL3Q9H2J4 239 aa27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 PRSS16Q9NQE7 514 aa27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 DDIT4Q9NX09 232 aa27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 RRN3Q9NYV6 651 aa27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 UPK3BL1B0FP48 263 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 UPK3BL2E5RIL1 263 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 H0Y626 953 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 ARHGAP33O14559 1287 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 DAB1O75553 588 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 PMLP29590 882 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 CSKP41240 450 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 SLC6A3Q01959 620 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 KCNMA1Q12791 1236 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 SLC12A1Q13621 1099 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 ARID5BQ14865 1188 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 HDDC3Q8N4P3 179 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 MYEOVQ96EZ4 313 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa27.6■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 CHD8Q9HCK8 2581 aa27.59■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 METTL12A8MUP2 240 aa27.59■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 OXCT1P55809 520 aa27.59■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 PLEKHG6Q3KR16 790 aa27.59■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 PTPN20Q4JDL3 420 aa27.59■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 PITRM1Q5JRX3 1037 aa27.59■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 RABGAP1LQ5R372 815 aa27.59■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 CFAP52Q8N1V2 620 aa27.59■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 RNF34Q969K3 372 aa27.59■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 SLC32A1Q9H598 525 aa27.59■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 SCML1Q9UN30 329 aa27.59■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 FHOD1Q9Y613 1164 aa27.59■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 A0A1B0GTW7 788 aa27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 OPHN1O60890 802 aa27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 DNTTP04053 509 aa27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 ERBB2P04626 1255 aa27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 TPM2P07951 284 aa27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 UCHL3P15374 230 aa27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 CYP11B1P15538 503 aa27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 NOS2P35228 1153 aa27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 SCNN1AP37088 669 aa27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 CACUL1Q86Y37 369 aa27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 ZNF366Q8N895 744 aa27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 MYO19Q96H55 970 aa27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 PPP1R9BQ96SB3 815 aa27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 PLCB1Q9NQ66 1216 aa27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa27.58■■■□□ 2.01
ODC1-204ENST00000446285 RPS14P62263 151 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 SHC2P98077 582 aa27.57■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 FSCBQ5H9T9 825 aa27.57■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 DCAF12L1Q5VU92 463 aa27.57■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 MSANTD4Q8NCY6 345 aa27.57■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 STK33Q9BYT3 514 aa27.57■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa27.57■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 EPG5Q9HCE0 2579 aa27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 A0A1B0GVM2 712 aa27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 TCAF2A6NFQ2 919 aa27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 GOLGA6L22H0YM25 854 aa27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 GRAP2O75791 330 aa27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 LSM8O95777 96 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 MATKP42679 507 aa27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 SULT2A1Q06520 285 aa27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 SEMA3BQ13214 749 aa27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 MINDY1Q8N5J2 469 aa27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 MRGPRX3Q96LB0 322 aa27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 BTBD1Q9H0C5 482 aa27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms