RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	PRKCB	P05771	671 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	HMGCS2	P54868	508 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	IGBP1	P78318	339 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	PORCN	Q9H237	461 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	FZD1	Q9UP38	647 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	NEMP1	O14524	444 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	MAGEC1	O60732	1142 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	APOE	P02649	317 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	ERBB2	P04626	1255 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	TYK2	P29597	1187 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	ETV4	P43268	484 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	RAB15	P59190	212 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	ACTR3	P61158	418 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	NXN	Q6DKJ4	435 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	WDR49	Q8IV35	697 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	C7orf31	Q8N865	590 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	NETO2	Q8NC67	525 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	USP33	Q8TEY7	942 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	CDKL2	Q92772	493 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	GCNA	Q96QF7	691 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	NEURL2	Q9BR09	285 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	CEP41	Q9BYV8	373 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	VWA5A	O00534	786 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	AIM2	O14862	343 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	KLHL41	O60662	606 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	PLA2G6	O60733	806 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	CSH1	P0DML2	217 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	CSH2	P0DML3	217 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNA2	P16389	499 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	BTK	Q06187	659 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	RAB6C	Q53S08	254 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	FETUB	Q9UGM5	382 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	GINS2	Q9Y248	185 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	NRAP	Q86VF7	1730 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	DCX	O43602	365 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	ITGB3	P05106	788 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	CYP2C9	P11712	490 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	GPD1	P21695	349 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	AQP4	P55087	323 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	CAPS	Q13938	189 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	BORA	Q6PGQ7	559 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF276	Q8N554	614 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	CCNY	Q8ND76	341 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	HGH1	Q9BTY7	390 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	THAP1	Q9NVV9	213 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	OGT	O15294	1046 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	FKBP6	O75344	327 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	DGKI	O75912	1065 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	HSPA4L	O95757	839 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	CXCL8	P10145	99 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	RAG1	P15918	1043 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	PEX2	P28328	305 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC1A6	P48664	564 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	BCAP31	P51572	246 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	STAT5B	P51692	787 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC18A2	Q05940	514 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	DMPK	Q09013	629 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	STXBP2	Q15833	593 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SSUH2-208	ENST00000455157	RNF148	Q8N7C7	305 aa		11.67	□□□□□ -0.54

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