RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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VSX1-205ENST00000429762 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
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VSX1-205ENST00000429762 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.81■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 GOLGA8MH3BSY2 632 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 PRRG1O14668 218 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 TLL1O43897 1013 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 TWF1Q12792 350 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.8■■□□□ 1.24
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VSX1-205ENST00000429762 TPGS2Q68CL5 300 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 IQCKQ8N0W5 287 aa22.8■■□□□ 1.24
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VSX1-205ENST00000429762 HERVK_113Q902F9 699 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 OLFM3Q96PB7 478 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 SLC12A8A0AV02 714 aa22.8■■□□□ 1.24
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VSX1-205ENST00000429762 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
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VSX1-205ENST00000429762 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 NEU3Q9UQ49 428 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 TLR6Q9Y2C9 796 aa22.8■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 KCNU1A8MYU2 1149 aa22.79■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 TLR5O60602 858 aa22.79■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 LILRB3O75022 631 aa22.79■■□□□ 1.24
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VSX1-205ENST00000429762 SLC39A13Q96H72 371 aa22.79■■□□□ 1.24
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VSX1-205ENST00000429762 OSBPL2Q9H1P3 480 aa22.79■■□□□ 1.24
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VSX1-205ENST00000429762 MTM1Q13496 603 aa22.78■■□□□ 1.24
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VSX1-205ENST00000429762 TAF12Q16514 161 aa22.77■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 CCNYQ8ND76 341 aa22.77■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.77■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.77■■□□□ 1.24
VSX1-205ENST00000429762 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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VSX1-205ENST00000429762 GPS2Q13227 327 aa22.76■■□□□ 1.23
VSX1-205ENST00000429762 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
VSX1-205ENST00000429762 TMC7Q7Z402 723 aa22.76■■□□□ 1.23
VSX1-205ENST00000429762 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
VSX1-205ENST00000429762 RTP4Q96DX8 246 aa22.76■■□□□ 1.23
VSX1-205ENST00000429762 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
VSX1-205ENST00000429762 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
VSX1-205ENST00000429762 CFAP69A5D8W1 941 aa22.76■■□□□ 1.23
VSX1-205ENST00000429762 H0YGN5 161 aa22.76■■□□□ 1.23
VSX1-205ENST00000429762 TMEM63AO94886 807 aa22.76■■□□□ 1.23
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