RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 PIGKQ92643 395 aa18.5■□□□□ 0.55
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HDDC3-201ENST00000330334 PILRBQ9UKJ0 227 aa18.5■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 CLEC4EQ9ULY5 219 aa18.5■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa18.5■□□□□ 0.55
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HDDC3-201ENST00000330334 IRAK2O43187 625 aa18.49■□□□□ 0.55
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HDDC3-201ENST00000330334 SLC4A5Q9BY07 1137 aa18.49■□□□□ 0.55
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HDDC3-201ENST00000330334 IL12RB1P42701 662 aa18.48■□□□□ 0.55
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HDDC3-201ENST00000330334 SLC23A3Q6PIS1 610 aa18.48■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 GBP6Q6ZN66 633 aa18.48■□□□□ 0.55
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HDDC3-201ENST00000330334 TMEM110Q86TL2 294 aa18.48■□□□□ 0.55
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HDDC3-201ENST00000330334 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 CEP76Q8TAP6 659 aa18.48■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa18.48■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM74BQ9NUR3 256 aa18.48■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 RAD54BQ9Y620 910 aa18.48■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 NUP205Q92621 2012 aa18.48■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 TPRP12270 2363 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 C4orf47A7E2U8 309 aa18.47■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 PIK3R2O00459 728 aa18.47■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 MSI1O43347 362 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 CALCAP01258 141 aa18.47■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 NCAM1P13591 858 aa18.47■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 HLA-FP30511 346 aa18.47■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 TBX4P57082 545 aa18.47■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF234Q14588 700 aa18.47■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 EXOC3L4Q17RC7 722 aa18.47■□□□□ 0.55
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HDDC3-201ENST00000330334 PIK3R6Q5UE93 754 aa18.47■□□□□ 0.55
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HDDC3-201ENST00000330334 TMEM9BQ9NQ34 198 aa18.47■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 ITM2CQ9NQX7 267 aa18.47■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 APEX2Q9UBZ4 518 aa18.47■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 TLR6Q9Y2C9 796 aa18.47■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 PATE3B3GLJ2 98 aa18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 ACSL4O60488 711 aa18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 SLC9A1P19634 815 aa18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 ITPKAP23677 461 aa18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF33AQ06730 810 aa18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 DUOXA1Q1HG43 343 aa18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 TRIM61Q5EBN2 209 aa18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 DENND1BQ6P3S1 775 aa18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 SLC39A13Q96H72 371 aa18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 CRACR2AQ9BSW2 395 aa18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 CIPCQ9C0C6 399 aa18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 CLSTN2Q9H4D0 955 aa18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 THAP9Q9H5L6 903 aa18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 ST7Q9NRC1 585 aa18.46■□□□□ 0.55
HDDC3-201ENST00000330334 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
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HDDC3-201ENST00000330334 IGLV3-19P01714 112 aa18.45■□□□□ 0.54
HDDC3-201ENST00000330334 PON1P27169 355 aa18.45■□□□□ 0.54
HDDC3-201ENST00000330334 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
HDDC3-201ENST00000330334 GNA15P30679 374 aa18.45■□□□□ 0.54
HDDC3-201ENST00000330334 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HDDC3-201ENST00000330334 CLEC17AQ6ZS10 378 aa18.45■□□□□ 0.54
HDDC3-201ENST00000330334 ARMCX6Q7L4S7 300 aa18.45■□□□□ 0.54
HDDC3-201ENST00000330334 ADIPOR2Q86V24 386 aa18.45■□□□□ 0.54
HDDC3-201ENST00000330334 TMPRSS6Q8IU80 811 aa18.45■□□□□ 0.54
HDDC3-201ENST00000330334 AHI1Q8N157 1196 aa18.45■□□□□ 0.54
HDDC3-201ENST00000330334 SHC3Q92529 594 aa18.45■□□□□ 0.54
HDDC3-201ENST00000330334 FOXJ1Q92949 421 aa18.45■□□□□ 0.54
HDDC3-201ENST00000330334 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM245Q9H330 911 aa18.45■□□□□ 0.54
HDDC3-201ENST00000330334 CYP8B1Q9UNU6 501 aa18.45■□□□□ 0.54
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