RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237696.9

RARRES1-201, Transcript of retinoic acid receptor responder 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RARRES1, Length 1,952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1-201ENST00000237696 CCDC25Q86WR0 208 aa19.26■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 ATL2Q8NHH9 583 aa19.26■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 ACTL9Q8TC94 416 aa19.26■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 CCHCR1Q8TD31 782 aa19.26■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 TOP1MTQ969P6 601 aa19.26■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 PLCD4Q9BRC7 762 aa19.26■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 TMEM175Q9BSA9 504 aa19.26■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 VN1R3Q9BXE9 311 aa19.26■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 AP4E1Q9UPM8 1137 aa19.26■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 ZNF148Q9UQR1 794 aa19.26■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 AMHP03971 560 aa19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 RPL17P18621 184 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 EN2P19622 333 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 ZNF280DQ6N043 979 aa19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 C1orf228Q6PIY5 440 aa19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 RHBDF2Q6PJF5 856 aa19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 BBS12Q6ZW61 710 aa19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 LRRN4Q8WUT4 740 aa19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 NT5C3BQ969T7 300 aa19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 CRISPLD1Q9H336 500 aa19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 ASIC3Q9UHC3 531 aa19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 COL4A6Q14031 1691 aa19.25■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 C2CD2LO14523 706 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 TNFRSF10BO14763 440 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 ADAM12O43184 909 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 SUN1O94901 812 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 CPB1P15086 417 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 L1CAMP32004 1257 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 CAV1Q03135 178 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 DEUP1Q05D60 604 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 BSPRYQ5W0U4 402 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 STRADAQ7RTN6 431 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 GSTA5Q7RTV2 222 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 PCDH19Q8TAB3 1148 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 TEKT4Q8WW24 435 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 TMEM121Q9BTD3 319 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 ANLNQ9NQW6 1124 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 AAASQ9NRG9 546 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 MTMR10Q9NXD2 777 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 KIAA0355O15063 1070 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 RFC2P35250 354 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 WDR5P61964 334 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 LONRF1Q17RB8 773 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 CCDC38Q502W7 563 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 PM20D1Q6GTS8 502 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 CCDC33Q8N5R6 958 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 PQLC3Q8N755 202 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 GRK7Q8WTQ7 553 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 SNF8Q96H20 258 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 RNF157Q96PX1 679 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 TTPALQ9BTX7 342 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 ABCF3Q9NUQ8 709 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 NUDT5Q9UKK9 219 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 USP3Q9Y6I4 520 aa19.24■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 TMEM120BA0PK00 339 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 MDM4O15151 490 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 TCEA3O75764 348 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 VNN2O95498 520 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 NRLP54845 237 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 PTK6Q13882 451 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 DDIT4Q9NX09 232 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 FZD10Q9ULW2 581 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 STAP1Q9ULZ2 295 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 NEU2Q9Y3R4 380 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 I6L893 689 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 TP73O15350 636 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 VCPP55072 806 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 USP46P62068 366 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 E2F5Q15329 346 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 OASLQ15646 514 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 GALNTL6Q49A17 601 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 BNIPLQ7Z465 357 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 NETO2Q8NC67 525 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 EFR3BQ9Y2G0 817 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 CDY1Q9Y6F8 540 aa19.23■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 TCP11X1B4DZS4 312 aa19.22■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 CAPN15O75808 1086 aa19.22■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 UBOX5O94941 541 aa19.22■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 ACSL3O95573 720 aa19.22■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 TTC4O95801 387 aa19.22■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 NQO1P15559 274 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 PDK2Q15119 407 aa19.22■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 KCNT2Q6UVM3 1135 aa19.22■□□□□ 0.67
RARRES1-201ENST00000237696 VSTM1Q6UX27 236 aa19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms