RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	NLRP4	Q96MN2	994 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TPK1	Q9H3S4	243 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	AP1G1	O43747	822 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	PDGFRA	P16234	1089 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	S100A1	P23297	94 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	PPP2R5D	Q14738	602 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP2A3	Q93084	1043 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SKA1	Q96BD8	255 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ITPKC	Q96DU7	683 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	CYLD	Q9NQC7	956 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	MED7	O43513	233 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TFAP2A	P05549	437 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNA4	P22459	653 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	RGS7	P49802	495 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	COG7	P83436	770 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TFDP2	Q14188	446 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	MMEL1	Q495T6	779 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	VPS50	Q96JG6	964 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	EBF4	Q9BQW3	602 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	DMTF1	Q9Y222	760 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157		F8W8V4	182 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	APOC2	P02655	101 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	NADK2	Q4G0N4	442 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	LPCAT4	Q643R3	524 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	C14orf80	Q86SX3	495 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	RNF149	Q8NC42	400 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	DRC3	Q9H069	523 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	RSAD1	Q9HA92	442 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNK13	Q9HB14	408 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	YDJC	A8MPS7	323 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ZMPSTE24	O75844	475 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	UQCRB	P14927	111 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC5A2	P31639	672 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	PACS1	Q6VY07	963 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	RAPH1	Q70E73	1250 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	MMP19	Q99542	508 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TBC1D12	O60347	775 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	PROC	P04070	461 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	RBL1	P28749	1068 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	CHN2	P52757	468 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	PRKG1	Q13976	671 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSUH2-208	ENST00000455157	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.71	□□□□□ -0.53

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