RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474312.5

GIGYF2-231, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 2

Gene GIGYF2, Length 4,687 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-231	ENST00000474312	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	KLHL35	Q6PF15	583 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	PALB2	Q86YC2	1186 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	CAVIN3	Q969G5	261 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	E2F7	Q96AV8	911 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	QSOX1	O00391	747 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	KCNN4	O15554	427 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	KRT14	P02533	472 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	TYK2	P29597	1187 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	C21orf59	P57076	290 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	POU5F1B	Q06416	359 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	GRM3	Q14832	879 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	VSTM1	Q6UX27	236 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	HASPIN	Q8TF76	798 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	ZIM3	Q96PE6	472 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312		A0A1W2PQ67	120 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	FAM170A	A1A519	330 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	PIK3R2	O00459	728 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	ATP9B	O43861	1147 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	SUPT3H	O75486	399 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	TMEM253	P0C7T8	217 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	PRLR	P16471	622 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	SERPINA4	P29622	427 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	PTGER2	P43116	358 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	ACLY	P53396	1101 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	TLE2	Q04725	743 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	GPS1	Q13098	491 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	MAPRE2	Q15555	327 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	ANKS6	Q68DC2	871 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	USP49	Q70CQ1	688 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	UBA3	Q8TBC4	463 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	MGARP	Q8TDB4	240 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24	4e-6	■■■■□ 21.9
GIGYF2-231	ENST00000474312	HSFY1	Q96LI6	401 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	VPS11	Q9H270	941 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	CD248	Q9HCU0	757 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	CASS4	Q9NQ75	786 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	ATG13	O75143	517 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	FAM107A	O95990	144 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	POLB	P06746	335 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	GZMA	P12544	262 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	ATP6V1E1	P36543	226 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	MAP3K7CL	P57077	242 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	PTEN	P60484	403 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	STK4	Q13043	487 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	NTRK3	Q16288	839 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	TREML2	Q5T2D2	321 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	RASSF3	Q86WH2	238 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	BSND	Q8WZ55	320 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	CASP10	Q92851	521 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	7.29	□□□□□ -1.24	2e-7	■■□□□ 12.2
GIGYF2-231	ENST00000474312	SENP2	Q9HC62	589 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	ASB3	Q9Y575	518 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	SYN3	O14994	580 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	PALM	O75781	387 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GIGYF2-231	ENST00000474312	SERPIND1	P05546	499 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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