RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591081.1

GALNT1-205, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT1, Length 1,120 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GALNT1-205	ENST00000591081	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	REPS1	Q96D71	796 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	APIP	Q96GX9	242 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	TISP43	B9A030	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	GOLIM4	O00461	696 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	LATS1	O95835	1130 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	TUBB4A	P04350	444 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	NPS	P0C0P6	89 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	ZNF213	O14771	459 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	KCNA3	P22001	575 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	DGKE	P52429	567 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	CACNB3	P54284	484 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	TPTE	P56180	551 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	KRT17	Q04695	432 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	E2F2	Q14209	437 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	GLG1	Q92896	1179 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081		A1L4Q6	167 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081		H7C4K7	107 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	APAF1	O14727	1248 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	FRS3	O43559	492 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	MARCH6	O60337	910 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	ITGA8	P53708	1063 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	WNT3	P56703	355 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	FAM193A	P78312	1265 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	CYP4F2	P78329	520 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	RAB32	Q13637	225 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	CYP2C9	P11712	490 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	IL1R1	P14778	569 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	LRPAP1	P30533	357 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GALNT1-205	ENST00000591081	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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