RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	MED10	Q9BTT4	135 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM92A	A1XBS5	289 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	CES2	O00748	559 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	PROSC	O94903	275 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	CTSA	P10619	480 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	BDNF	P23560	247 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	AMPD2	Q01433	879 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMD5	Q16401	504 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	CD101	Q93033	1021 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	HES6	Q96HZ4	224 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	SPATA17	Q96L03	361 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	TLR10	Q9BXR5	811 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	ST7	Q9NRC1	585 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	AMFR	Q9UKV5	643 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM66	O15016	1216 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	UROD	P06132	367 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	ATF2	P15336	505 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	MAP3K7CL	P57077	242 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	ADCY1	Q08828	1119 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	C2CD6	Q53TS8	623 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC38	Q5VT99	294 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	RTL10	Q7L3V2	364 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	DAAM2	Q86T65	1068 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	NT5C3B	Q969T7	300 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNK16	Q96T55	309 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	PBX4	Q9BYU1	374 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF14	Q9UBS8	474 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TRAF4-208	ENST00000469529	MTMR11	A4FU01	709 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	DPYSL4	O14531	572 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	ENDOD1	O94919	500 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	VNN2	O95498	520 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP2F1	P24903	491 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	CTNNA2	P26232	953 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	PBX2	P40425	430 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	PTPN9	P43378	593 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	RGS7	P49802	495 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	TKTL1	P51854	596 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	CACNA2D1	P54289	1103 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	ROR1	Q01973	937 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS6KA1	Q15418	735 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	PEX26	Q7Z412	305 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF276	Q8N554	614 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	B3GALT6	Q96L58	329 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	RRN3	Q9NYV6	651 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TRAF4-208	ENST00000469529	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27

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