RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SCAMP4Q969E2 229 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPSB4Q96A44 273 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EID2BQ96D98 161 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM167BQ9BTA0 163 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RASSF1Q9NS23 344 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A087WWL8 130 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACKR2O00590 384 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HAUS5O94927 633 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C1RP00736 705 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GRPP07492 148 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ITGA2BP08514 1039 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SRGNP10124 158 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TXNP10599 105 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 XBP1P17861 261 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PTH2RP49190 550 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 WNT3P56703 355 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAB30Q15771 203 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 INSCQ1MX18 579 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FBXO47Q5MNV8 452 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TSHZ3Q63HK5 1081 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TANGO2Q6ICL3 276 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF365Q70YC5 407 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAATS1Q7Z4T9 603 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MPP5Q8N3R9 675 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RUBCNQ92622 972 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MRI1Q9BV20 369 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CHST8Q9H2A9 424 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPR35Q9HC97 309 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SAYSD1Q9NPB0 183 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TLK1Q9UKI8 766 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CA14Q9ULX7 337 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NOX1Q9Y5S8 564 aa5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1B0GTW7 788 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LGALS16A8MUM7 142 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCP110O43303 1012 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 POMCP01189 267 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ITGA5P08648 1049 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FPR1P21462 350 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC11A2P49281 568 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OCA2Q04671 838 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC29A2Q14542 456 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 POSTNQ15063 836 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MED25Q71SY5 747 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC15A4Q8N697 577 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAML1Q92585 1016 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LRRC46Q96FV0 321 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BOD1Q96IK1 185 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 Q96MF0 132 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PPP1R9BQ96SB3 815 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DUSP26Q9BV47 211 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 STK31Q9BXU1 1019 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RNPEPQ9H4A4 650 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM83DQ9H4H8 585 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KIF17Q9P2E2 1029 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HDAC9Q9UKV0 1011 aa5.75□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RRN3P2A6NIE6 340 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 WNT10BO00744 389 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GLP2RO95838 553 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CDK4P11802 303 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GCSHP23434 173 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAAH2Q6GMR7 532 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 Q6ZNX1 250 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 WDR26Q9H7D7 661 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ITM2CQ9NQX7 267 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TBC1D23Q9NUY8 699 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RGL1Q9NZL6 768 aa5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 149.1 ms