RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 ARTNQ5T4W7 220 aa5.09□□□□□ -1.59
ANKRD28-212ENST00000497037 LIN9Q5TKA1 542 aa5.09□□□□□ -1.59
ANKRD28-212ENST00000497037 ARHGAP17Q68EM7 881 aa5.09□□□□□ -1.59
ANKRD28-212ENST00000497037 NPNTQ6UXI9 565 aa5.09□□□□□ -1.59
ANKRD28-212ENST00000497037 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.09□□□□□ -1.59
ANKRD28-212ENST00000497037 HDXQ7Z353 690 aa5.09□□□□□ -1.59
ANKRD28-212ENST00000497037 ADGRF2Q8IZF7 708 aa5.09□□□□□ -1.59
ANKRD28-212ENST00000497037 KRT222Q8N1A0 295 aa5.09□□□□□ -1.59
ANKRD28-212ENST00000497037 CRYBG2Q8N1P7 616 aa5.09□□□□□ -1.59
ANKRD28-212ENST00000497037 SH3GL2Q99962 352 aa5.09□□□□□ -1.59
ANKRD28-212ENST00000497037 ADAM2Q99965 735 aa5.09□□□□□ -1.59
ANKRD28-212ENST00000497037 ZWILCHQ9H900 591 aa5.09□□□□□ -1.59
ANKRD28-212ENST00000497037 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa5.09□□□□□ -1.59
ANKRD28-212ENST00000497037 SCINQ9Y6U3 715 aa5.09□□□□□ -1.59
ANKRD28-212ENST00000497037 MYBPHLA2RUH7 354 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 A8MXQ7 604 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 PODXLO00592 558 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 ATP8B1O43520 1251 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 FYNP06241 537 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 GNAT1P11488 350 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 KRT3P12035 628 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 WARSP23381 471 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 PSMA2P25787 234 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 MIPP30301 263 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC1A1P43005 524 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 TAF6P49848 677 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 EPHB4P54760 987 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 CDC42EP1Q00587 391 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 KAZNQ674X7 775 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 RHBDF2Q6PJF5 856 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM110Q86TL2 294 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 LRRTM3Q86VH5 581 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 IQCKQ8N0W5 287 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 OR10T2Q8NGX3 314 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 FBXO25Q8TCJ0 367 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 PXYLP1Q8TE99 480 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 RXFP2Q8WXD0 754 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 KCNK16Q96T55 309 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 ERP44Q9BS26 406 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 MIS12Q9H081 205 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 PCSK1NQ9UHG2 260 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 IP6K2Q9UHH9 426 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 DNPEPQ9ULA0 475 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 FAN1Q9Y2M0 1017 aa5.09□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 CYB561D2O14569 222 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 NRP1O14786 923 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 KRT14P02533 472 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 KRT1P04264 644 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 KLRC2P26717 231 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 HSD17B3P37058 310 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 CDK7P50613 346 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 HDAC4P56524 1084 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 KRT17Q04695 432 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 MYO1EQ12965 1108 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 MDH1BQ5I0G3 518 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 SEL1L2Q5TEA6 688 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 CLEC20AQ6ZU45 233 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 TMC3Q7Z5M5 1100 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 ECHDC2Q86YB7 292 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 CRIPAKQ8N1N5 446 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 NETO2Q8NC67 525 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 EXD1Q8NHP7 514 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 RAET1EQ8TD07 263 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 RUBCNQ92622 972 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 SENP8Q96LD8 212 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 SMOQ99835 787 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 OSBPL8Q9BZF1 889 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 DNAJB4Q9UDY4 337 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 C5orf42Q9H799 3197 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A0U1RQF3 1178 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 DCDC2CA8MYV0 355 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 C9IYK1 514 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 MED7O43513 233 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 LIASO43766 372 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 ENDOD1O94919 500 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 LCP1P13796 627 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 TUBB4BP68371 445 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 PAK2Q13177 524 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 OASLQ15646 514 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 CDO1Q16878 200 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 OR6B2Q6IFH4 312 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 BNIPLQ7Z465 357 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM126BQ8IXS8 530 aa5.08□□□□□ -1.6
ANKRD28-212ENST00000497037 IFT20Q8IY31 132 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms