RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 UNC5CO95185 931 aa27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 HADHQ16836 314 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 HAUS1Q96CS2 278 aa27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 LHX5Q9H2C1 402 aa27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 SIGLEC16A6NMB1 481 aa27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 KRT16P08779 473 aa27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 PSMA2P25787 234 aa27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 TM4SF4P48230 202 aa27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ARL4CP56559 192 aa27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 FAM110CQ1W6H9 321 aa27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 DEFB115Q30KQ5 88 aa27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ZNF699Q32M78 642 aa27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 TFAP2BQ92481 460 aa27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 TTLL13PA6NNM8 815 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 MED7O43513 233 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 IFNB1P01574 187 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 CCND1P24385 295 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 CNTN2Q02246 1040 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 PDE4CQ08493 712 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 KCTD2Q14681 263 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 TAZQ16635 292 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ZNF394Q53GI3 561 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 CYP4A22Q5TCH4 519 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 BBS12Q6ZW61 710 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 THNSL1Q8IYQ7 743 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 PLCD3Q8N3E9 789 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ATP11CQ8NB49 1132 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 LRRC8CQ8TDW0 803 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 TBC1D31Q96DN5 1066 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 MMP19Q99542 508 aa27.16■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 TYROBPO43914 113 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 EDF1O60869 148 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 PRKCBP05771 671 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 CA4P22748 312 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ELF1P32519 619 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 MSH2P43246 934 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 DNAJC3Q13217 504 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 EXOC8Q8IYI6 725 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ANKLE1Q8NAG6 615 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 C2orf40Q9H1Z8 148 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 DCTN3O75935 186 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ZWINTO95229 277 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 TSHRP16473 764 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ALDH3A1P30838 453 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ASPAP45381 313 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 HHATQ5VTY9 493 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 CXorf56Q9H5V9 222 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 WDR35Q9P2L0 1181 aa27.15■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ABLIM1O14639 778 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 TNNC2P02585 160 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 WEE2P0C1S8 567 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 KRT3P12035 628 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 NOGQ13253 232 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 MAPK6Q16659 721 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 KLHL38Q2WGJ6 581 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 DENND1BQ6P3S1 775 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 KIF2BQ8N4N8 673 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ACTL9Q8TC94 416 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 AGAP11Q8TF27 550 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 SEPT1Q8WYJ6 367 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 XYLT2Q9H1B5 865 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 KIF9Q9HAQ2 790 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 CPA4Q9UI42 421 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 RABGEF1Q9UJ41 708 aa27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
OPN3-204ENST00000469376 WFS1O76024 890 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 HOXC6P09630 235 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 EDNRBP24530 442 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 GPX6P59796 221 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 PTPN20Q4JDL3 420 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 TLDC1Q6P9B6 456 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 C4orf33Q8N1A6 199 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 NAT8LQ8N9F0 302 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 PYROXD1Q8WU10 500 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 CAPNS2Q96L46 248 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 CLUHO75153 1309 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 E7ESA3 106 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 LRCH4O75427 683 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 TGFB3P10600 412 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 KDELR1P24390 212 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 PARP6Q2NL67 630 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 SPDYAQ5MJ70 313 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 GPATCH11Q8N954 259 aa27.13■■□□□ 1.93
OPN3-204ENST00000469376 CPT1BQ92523 772 aa27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.5 ms