RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 ZXDAP98168 799 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 CYP27A1Q02318 531 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 VEPH1Q14D04 833 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 GAREM2Q75VX8 874 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 ITIH5Q86UX2 942 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 IRF2BP1Q8IU81 584 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 SHKBP1Q8TBC3 707 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 FAM200AQ8TCP9 573 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 EDAQ92838 391 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 TATDN2Q93075 761 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 MCRS1Q96EZ8 462 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 B3GNT5Q9BYG0 378 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 CYP3A43Q9HB55 503 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 C11orf16Q9NQ32 467 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 IGSF9Q9P2J2 1179 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 SORCS3Q9UPU3 1222 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 PMM2O15305 246 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 INCA1Q0VD86 236 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 ORC1Q13415 861 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 MTMR3Q13615 1198 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 HTR4Q13639 388 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 PARM1Q6UWI2 310 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 ACOT1Q86TX2 421 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 UNC93AQ86WB7 457 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 CRYBG2Q8N1P7 616 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 CCDC150Q8NCX0 1101 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 WHAMMQ8TF30 809 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 FGF14Q92915 247 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 FAXDC2Q96IV6 333 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 TWNKQ96RR1 684 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 IL21Q9HBE4 155 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 TMEM30AQ9NV96 361 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 GDE1Q9NZC3 331 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 A0A1W2PRU2 124 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 CLDN5O00501 218 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 CACNA2D1P54289 1103 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 KCNH2Q12809 1159 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 TEAD2Q15562 447 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 WDR44Q5JSH3 913 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 VSTM1Q6UX27 236 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 PAQR9Q6ZVX9 377 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 SCN4BQ8IWT1 228 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 SLC44A3Q8N4M1 653 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 NXPE3Q969Y0 559 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 TNIP3Q96KP6 325 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 ZSWIM3Q96MP5 696 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 ARID3AQ99856 593 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 NUMBLQ9Y6R0 609 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 FAM86C2PA6NEL3 165 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 SLC38A8A6NNN8 435 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 CILPO75339 1184 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 NOL4O94818 638 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 CSH1P0DML2 217 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 CSH2P0DML3 217 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 CCDC192P0DO97 292 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 CD58P19256 250 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 GABRR2P28476 465 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 TDGQ13569 410 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 STXBP5Q5T5C0 1151 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 TMEM150AQ86TG1 271 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 LMO3Q8TAP4 145 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 TMEM63CQ9P1W3 806 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 DACH1Q9UI36 760 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.274e-16■□□□□ 9.9
ACTB-206ENST00000443528 P4HA2O15460 535 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 NARSO43776 548 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 GPR37L1O60883 481 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 FGF19O95750 216 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 AFPP02771 609 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 F11P03951 625 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 FCARP24071 287 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 GRIK1P39086 918 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 TAF12Q16514 161 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 FAM78AQ5JUQ0 283 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 TRIM67Q6ZTA4 783 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 MTSS1LQ765P7 747 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 FAM35AQ86V20 835 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 UBALD2Q8IYN6 164 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 FUKQ8N0W3 1084 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 C12orf29Q8N999 325 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 SPATA17Q96L03 361 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 C8orf48Q96LL4 319 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 MYRFLQ96LU7 910 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 ASB16Q96NS5 453 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 ELOVL4Q9GZR5 314 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 ATXN3LQ9H3M9 355 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 THAP9Q9H5L6 903 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 CISHQ9NSE2 258 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-206ENST00000443528 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
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