RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 RNF220Q5VTB9 566 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 ZBTB46Q86UZ6 589 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 PDZD8Q8NEN9 1154 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 HDAC11Q96DB2 347 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 KREMEN1Q96MU8 473 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 ZBBXA8MT70 800 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 CRADDP78560 199 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 DUOXA2Q1HG44 320 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 WWP1Q9H0M0 922 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 KIAA1586Q9HCI6 787 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 H0YCG3 227 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 FCHO1O14526 889 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 CALB2P22676 271 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 SDC4P31431 198 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 FAAP100Q0VG06 881 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 CUL2Q13617 745 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 PID1Q7Z2X4 250 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 ETNPPLQ8TBG4 499 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 STK32AQ8WU08 396 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 USP6NLQ92738 828 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 MYH15Q9Y2K3 1946 aa18.51■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 KCNA4P22459 653 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 SATB1Q01826 763 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 PGBD4Q96DM1 585 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 DCLRE1BQ9H816 532 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 USP1O94782 785 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 GYS1P13807 737 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 SLC1A5Q15758 541 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 TRIM42Q8IWZ5 723 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 SLC17A7Q9P2U7 560 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 E9PBE3 544 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 KLHL41O60662 606 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 TUBB6Q9BUF5 446 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 FEM1BQ9UK73 627 aa18.5■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 M0R2N6 131 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 PIK3CDO00329 1044 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 GPC3P51654 580 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 IFNEQ86WN2 208 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 USP33Q8TEY7 942 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 SENP1Q9P0U3 644 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 V9GYQ6 96 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 NUDT17P0C025 328 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 OSBPP22059 807 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 POLD1P28340 1107 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 PTPN4P29074 926 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 DDR1Q08345 913 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 TFDP2Q14188 446 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 MTFR1Q15390 333 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 SLFN12LQ6IEE8 588 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 ZDHHC24Q6UX98 284 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 NPNTQ6UXI9 565 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF606Q8WXB4 792 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 C2CD2Q9Y426 696 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 RGPD1P0DJD0 1748 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 GLRBP48167 497 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 PRPSAP1Q14558 356 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 CNGA3Q16281 694 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 CNBD2Q96M20 576 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 GRHL1Q9NZI5 618 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa18.49■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 KBTBD13C9JR72 458 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 MED7O43513 233 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 SERPINB5P36952 375 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 OCRLQ01968 901 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 TTC13Q8NBP0 860 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 FAM13CQ8NE31 585 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 Q9H521 79 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 IL1RL2Q9HB29 575 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 ASNSD1Q9NWL6 643 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 EMC2Q15006 297 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 ANO4Q32M45 955 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 FAM136AQ96C01 138 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 SIX2Q9NPC8 291 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 GOLGA8TH3BQL2 631 aa18.48■□□□□ 0.55
NOMO3-201ENST00000263012 PEX1O43933 1283 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms