RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	SMARCD2	Q92925	531 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	MTRR	Q9UBK8	725 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		9.6	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	MSTN	O14793	375 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHD	P01880	384 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	MYL4	P12829	197 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	BCKDHB	P21953	392 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	FGFR3	P22607	806 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARPP19	P56211	112 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	RELB	Q01201	579 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	ROR1	Q01973	937 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	GRIK3	Q13003	919 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRRC32	Q14392	662 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	CASC1	Q6TDU7	716 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		9.59	□□□□□ -0.87
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	THADA	Q6YHU6	1953 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A087WWV3	80 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADAM23	O75077	832 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	TDP2	O95551	362 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	EDN1	P05305	212 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRKCB	P05771	671 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDR1	P51861	262 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDC42EP1	Q00587	391 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	CREM	Q03060	361 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	TUSC3	Q13454	348 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	FERMT3	Q86UX7	667 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	CNNM3	Q8NE01	707 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAX	Q9Y2V3	346 aa		9.58	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIP1	O00291	1037 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	ERLIN2	O94905	339 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	ABLIM3	O94929	683 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	VNN2	O95498	520 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	EGF	P01133	1207 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRG1	P02750	347 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHML	P26374	656 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	RFC5	P40937	340 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	LIFR	P42702	1097 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAPK8	P45983	427 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	JAK3	P52333	1124 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTEN	P60484	403 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	NOTUM	Q6P988	496 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	APOA5	Q6Q788	366 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	FRMD1	Q8N878	549 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	CEP170P1	Q96L14	293 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRRC3	Q9BY71	257 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	9.57	□□□□□ -0.88
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		9.57	□□□□□ -0.88

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