RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP38Q8NB14 1042 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSWIM1Q9BR11 485 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SDCBP2Q9H190 292 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CARD9Q9H257 536 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRPA1O75762 1119 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GUCY2FP51841 1108 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTP4A2Q12974 167 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNA10Q16322 511 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPROQ16827 1216 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XKR4Q5GH76 650 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LIN9Q5TKA1 542 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC70Q6NSX1 233 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM228AQ86W67 206 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PASD1Q8IV76 773 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM59LQ9UK28 342 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HES2Q9Y543 173 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCN1AP35498 2009 aa23.28■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CILPO75339 1184 aa23.28■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RRM1P23921 792 aa23.28■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRD2P25440 801 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INCA1Q0VD86 236 aa23.28■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF394Q53GI3 561 aa23.28■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM130Q8N3G9 435 aa23.28■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BEST2Q8NFU1 509 aa23.28■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PXYLP1Q8TE99 480 aa23.28■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RUBCNQ92622 972 aa23.28■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.329e-7■■■■■ 27.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAM22Q9P0K1 906 aa23.28■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP104O60308 925 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMP8P22894 467 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCM3P25205 808 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAP1GAPP47736 663 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAD23BP54727 409 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYO1EQ12965 1108 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MESDQ14696 234 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC52Q8N7C0 313 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WHAMMQ8TF30 809 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TFAP2BQ92481 460 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD101Q93033 1021 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MED7O43513 233 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNE1P15382 129 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COMTP21964 271 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDH8P55286 799 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM35BQ8NCS4 154 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF446Q9NWS9 450 aa23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNNC1P63316 161 aa23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCAF12L1Q5VU92 463 aa23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBL4BQ8N7F7 174 aa23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WNT8BQ93098 351 aa23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C11orf70Q9BRQ4 267 aa23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LHX5Q9H2C1 402 aa23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCINQ9Y6U3 715 aa23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CENPFP49454 3210 aa23.26■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRIN2DO15399 1336 aa23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CABYRO75952 493 aa23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VSNL1P62760 191 aa23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MGAT3Q09327 533 aa23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLUL1Q15846 466 aa23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC4A11Q8NBS3 891 aa23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANAPC7Q9UJX3 599 aa23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IPPQ9Y573 584 aa23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP83Q9Y592 693 aa23.25■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CALB1P05937 261 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AKAP5P24588 427 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTNNA2P26232 953 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALG3Q92685 438 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM176AQ96HP8 235 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ELOVL4Q9GZR5 314 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARFGAP3Q9NP61 516 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHST12Q9NRB3 414 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC66A2RUB6 948 aa23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms