RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PRIM2P49643 509 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 MAP2K5Q13163 448 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 MMRN1Q13201 1228 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PARP10Q53GL7 1025 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 C10orf76Q5T2E6 689 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 NDUFS3O75489 264 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 STAG3L1P0CL83 205 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PSMA2P25787 234 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ATP5DP30049 168 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SCARF1Q14162 830 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 FMN1Q68DA7 1419 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 DNAJC24Q6P3W2 148 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SAMD7Q7Z3H4 446 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 FAM133AQ8N9E0 248 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 AGBL1Q96MI9 1066 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 TSSK1BQ9BXA7 367 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SOX13Q9UN79 622 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 HSD17B3P37058 310 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 POLNQ7Z5Q5 900 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 LRRC37BQ96QE4 947 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ISPDA4D126 451 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SUPT3HO75486 399 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 FKBP9O95302 570 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 FKBP9P1Q75LS8 142 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CORO1BQ9BR76 489 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CARD9Q9H257 536 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 VPS11Q9H270 941 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SLC39A2Q9NP94 309 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SUN1O94901 812 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 POMCP01189 267 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CHPFQ8IZ52 775 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 EPS15L1Q9UBC2 864 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 USP19O94966 1318 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 MYMKA6NI61 221 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SNTNA6NMZ2 147 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 A8MUI8 341 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 H3BUI4 141 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PSMD9O00233 223 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 OR10H2O60403 315 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 FAM20BO75063 409 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 BCL10O95999 233 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 KRT1P04264 644 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 EPHX2P34913 555 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 MTA1Q13330 715 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 OR5T3Q8NGG3 340 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 KLK6Q92876 244 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 FAM129BQ96TA1 746 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 KIFC1Q9BW19 673 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ING2Q9H160 280 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CXCR2P25025 360 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 GAB3Q8WWW8 586 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 E2F7Q96AV8 911 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CLCC1Q96S66 551 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CRLS1Q9UJA2 301 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 AMHP03971 560 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 TGM1P22735 817 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PRKAG1P54619 331 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ING5Q8WYH8 240 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 RABGGTAQ92696 567 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PGBD4Q96DM1 585 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 IL1RL2Q9HB29 575 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 KRT84Q9NSB2 600 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 KIAA1024Q9UPX6 916 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 GRAP2O75791 330 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PLD1Q13393 1074 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CYP27C1Q4G0S4 372 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 IER5Q5VY09 327 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 C3orf49Q96BT1 292 aa5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms