RNA–Protein interactions for RNA: YGL239C

YGL239C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGL239C, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL239C	YGL239C	KAP114	P53067	1004 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	PRM15	Q03262	622 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	VPS3	P23643	1011 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	MRPL37	P36532	105 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	COS8	P38723	381 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	RRF1	P38771	230 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	RCY1	P39531	840 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	0.95	□□□□□ -2.26	not detected
YGL239C	YGL239C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	EMP46	Q12396	444 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	Q0255	P03881	472 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	JEN1	P36035	616 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	MSA2	P36157	363 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	YHR125W	P38831	101 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	YER189W	P40104	122 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	SNZ3	P43545	298 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	ASI3	P53983	676 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	GOT1	Q03554	138 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	YDR124W	Q04608	324 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	COX20	Q04935	205 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	ATO3	Q12359	275 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	COX2	P00410	251 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	VMA11	P32842	164 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	DAD3	P69850	94 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	CTF19	Q02732	369 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	YDR209C	Q03480	137 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	ATG17	Q06410	417 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	AKR2	Q12013	749 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	SNF8	Q12483	233 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	YLR462W	O13556	202 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	YKR104W	P0CE69	306 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	DAL82	P21705	255 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	PEX4	P29340	183 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	YEL075C	P39972	122 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	PEP8	P40335	379 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	CIS3	P47001	227 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	MRH4	P53166	561 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	YGR026W	P53217	278 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	MRPS8	Q03799	155 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	EHD3	P28817	500 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	SGE1	P33335	543 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.91	□□□□□ -2.26	not detected
YGL239C	YGL239C	MRPL39	P36533	70 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	CTR2	P38865	189 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	YGL159W	P53110	370 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	SNZ2	P53824	298 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	YMR279C	Q03263	540 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	SPG4	Q04438	115 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	YLR030W	Q07967	263 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	COQ10	Q08058	207 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YGL239C	YGL239C	COX5A	P00424	153 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	CDC7	P06243	507 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	OM45	P16547	393 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YBR096W	P38256	230 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	MEP1	P40260	492 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	BMT5	P40493	336 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	PRM10	P42946	383 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	CYT2	Q00873	224 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	FAR8	Q05040	523 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YPR098C	Q06089	161 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YOR186W	Q08560	144 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	BTS1	Q12051	335 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YOL162W	P0CF19	215 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	DSF1	P0CX08	502 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YNR073C	P0CX09	502 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.89	□□□□□ -2.27	not detected
YGL239C	YGL239C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	FZO1	P38297	855 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	GOS1	P38736	223 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YHR022C	P38763	256 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	DOG1	P38774	246 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	BIG1	P38813	335 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	PET100	P38958	111 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	0.89	□□□□□ -2.27	not detected
YGL239C	YGL239C	FIS1	P40515	155 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	YAR1	P46683	200 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	GLG2	P47011	380 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	ERG25	P53045	309 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGL239C	YGL239C	USE1	P53146	245 aa		0.89	□□□□□ -2.27

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