RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 P3H4Q92791 437 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC35C1Q96A29 364 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF408Q9H9D4 720 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 GABBR1Q9UBS5 961 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 KIF20BQ96Q89 1820 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 K7ERI5 159 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAPPC3O43617 180 aa13.12□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 MMP10P09238 476 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 MTMR1Q13613 665 aa13.12□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 TAS1R2Q8TE23 839 aa13.12□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM121Q9BTD3 319 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 ARFIP2P53365 341 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 DRP2Q13474 957 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 CROCCP2Q86T23 111 aa13.12□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 ARHGEF19Q8IW93 802 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 KNL1Q8NG31 2342 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 NEMP1O14524 444 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 RARAP10276 462 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 NQO1P15559 274 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 PCGF5Q86SE9 256 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 TBC1D16Q8TBP0 767 aa13.12□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 HAS1Q92839 578 aa13.12□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 MCEEQ96PE7 176 aa13.12□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 C2orf71A6NGG8 1288 aa13.11□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 STAMBPO95630 424 aa13.11□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 CEP55Q53EZ4 464 aa13.11□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 H0YIN7 160 aa13.11□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 APRTP07741 180 aa13.11□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 ATP6V1B1P15313 513 aa13.11□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 PHBP35232 272 aa13.11□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 COPS2P61201 443 aa13.11□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 RCN1Q15293 331 aa13.11□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC27A3Q5K4L6 730 aa13.11□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa13.11□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 ZBTB46Q86UZ6 589 aa13.11□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 C4orf32Q8N8J7 132 aa13.11□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 FAF2Q96CS3 445 aa13.11□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 SNF8Q96H20 258 aa13.11□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 MSTO1Q9BUK6 570 aa13.11□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 VCX3BQ9H321 246 aa13.11□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 SMC1BQ8NDV3 1235 aa13.11□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 MTA3Q9BTC8 594 aa13.11□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 FAM129AQ9BZQ8 928 aa13.11□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa13.11□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 RASSF10A6NK89 507 aa13.1□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 MAP3K7O43318 606 aa13.1□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 AGTP01019 485 aa13.1□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 SSTR1P30872 391 aa13.1□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 SPRED3Q2MJR0 410 aa13.1□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 HGSNATQ68CP4 663 aa13.1□□□□□ -0.31
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