RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DAW1Q8N136 415 aa28.79■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DRC1Q96MC2 740 aa28.79■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFSD1Q9H3U5 465 aa28.79■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGSF9Q9P2J2 1179 aa28.79■■■□□ 2.2
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUBP1P53384 320 aa28.78■■■□□ 2.2
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RUSC1Q9BVN2 902 aa28.78■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKD2Q9BZL6 878 aa28.78■■■□□ 2.2
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RINT1Q6NUQ1 792 aa28.77■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDXDC1Q6P996 788 aa28.77■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMX3Q96JJ7 454 aa28.77■■■□□ 2.2
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa28.77■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM134Q9H6X4 195 aa28.77■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KMT5AQ9NQR1 393 aa28.77■■■□□ 2.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZMYND10O75800 440 aa28.76■■■□□ 2.19
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF568Q3ZCX4 644 aa28.76■■■□□ 2.19
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNK18Q7Z418 384 aa28.76■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYADMQ96S97 322 aa28.76■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDT1Q9H211 546 aa28.76■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa28.76■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPS15L1Q9UBC2 864 aa28.76■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DUSP12Q9UNI6 340 aa28.76■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H3BQV1 296 aa28.75■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GJB2P29033 226 aa28.75■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRM5P41594 1212 aa28.75■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YARSP54577 528 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPK7Q13164 816 aa28.75■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa28.75■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM105Q8N8V8 129 aa28.75■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UROC1Q96N76 676 aa28.75■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIPINQ9BVW5 301 aa28.75■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C17orf75Q9HAS0 396 aa28.75■■■□□ 2.19
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXW11Q9UKB1 542 aa28.75■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa28.74■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B3GAT3O94766 335 aa28.74■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIN9Q5TKA1 542 aa28.74■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP120Q8N960 986 aa28.74■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPRHQ9HD43 1115 aa28.74■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXL21Q9UKT6 434 aa28.74■■■□□ 2.19
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLCNKBP51801 687 aa28.73■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OSTNP61366 133 aa28.73■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAS1R3Q7RTX0 852 aa28.73■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSAD2Q8WXG1 361 aa28.73■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CACNA1HO95180 2353 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SFI1A8K8P3 1242 aa28.72■■■□□ 2.19
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGFR3P22607 806 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GUCY2CP25092 1073 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLCN5P51795 746 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UPP1Q16831 310 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HYIQ5T013 277 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCTD17Q8N5Z5 321 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FLCNQ8NFG4 579 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NXPE3Q969Y0 559 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCHPQ9BT92 498 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM86C1Q9NVL1 165 aa28.72■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VWA8A3KMH1 1905 aa28.71■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VWA3AA6NCI4 1184 aa28.71■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC16A4O15374 487 aa28.71■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAM12O43184 909 aa28.71■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAPPC3O43617 180 aa28.71■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP28.71■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCF2P10911 925 aa28.71■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XKR4Q5GH76 650 aa28.71■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPM1LQ5SGD2 360 aa28.71■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa28.71■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNMA5Q96PV4 448 aa28.71■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNG1Q9UIX4 513 aa28.71■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIP11Q15643 1979 aa28.71■■■□□ 2.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H0Y858 1186 aa28.7■■■□□ 2.18
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