RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486708.1

SFI1-224, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 2

Gene SFI1, Length 651 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-224	ENST00000486708	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	COBL	O75128	1261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ATP2C2	O75185	946 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	DRD2	P14416	443 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PDE6A	P16499	860 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RXRA	P19793	462 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	NR1D1	P20393	614 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CASP1	P29466	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SLC8A1	P32418	973 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ADD2	P35612	726 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	AFM	P43652	599 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ARL4D	P49703	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	NT5C2	P49902	561 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SEC24C	P53992	1094 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SLC8A3	P57103	927 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ICA1	Q05084	483 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PPARA	Q07869	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CRHR2	Q13324	411 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PHKB	Q93100	1093 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TCF12	Q99081	682 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PTPN18	Q99952	460 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	STOML1	Q9UBI4	398 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MYH8	P13535	1937 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708		A0A096LPE4	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	KRT86	O43790	486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	FBXO24	O75426	580 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	FAM107A	O95990	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	BMP3	P12645	472 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	GSTT1	P30711	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SSTR4	P31391	388 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PEX19	P40855	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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