RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	TMC6	Q7Z403	805 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	WNT8B	Q93098	351 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	ASB7	Q9H672	318 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	IL18RAP	O95256	599 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	THPO	P40225	353 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	GRM5	P41594	1212 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	BFSP2	Q13515	415 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	SYCP1	Q15431	976 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	GBP6	Q6ZN66	633 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	LMO3	Q8TAP4	145 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF623	O75123	536 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	CKB	P12277	381 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	PON1	P27169	355 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	ACOT2	P49753	483 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	DLG4	P78352	724 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP3CA	Q08209	521 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT39	Q6A163	491 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	TMX1	Q9H3N1	280 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	MYO6	Q9UM54	1294 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	SI	P14410	1827 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	TTC26	A0AVF1	554 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	EVI5	O60447	810 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	NOL4	O94818	638 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	STAG3L1	P0CL83	205 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	FECH	P22830	423 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	DSC3	Q14574	896 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	ZACN	Q401N2	412 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	SV2A	Q7L0J3	742 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	ZBTB33	Q86T24	672 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	SPC24	Q8NBT2	197 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	ACAP3	Q96P50	834 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	PANX2	Q96RD6	677 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	DERA	Q9Y315	318 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2

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