RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 GGA1Q9UJY5 639 aa3.9□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM33Q9UPN9 1127 aa3.9□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAH12Q6ZR08 3092 aa3.9□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GTF2IP78347 998 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 OGDHQ02218 1023 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MTMR3Q13615 1198 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ASIC2Q16515 512 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 RHOT2Q8IXI1 618 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 REPS2Q8NFH8 660 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CAGE1Q8TC20 777 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SHTN1A0MZ66 631 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SFI1A8K8P3 1242 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SORBS3O60504 671 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 UNC5CO95185 931 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MYZAPP0CAP1 466 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPTP10636 758 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 STAT1P42224 750 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 NCKAP1LP55160 1127 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXB2Q5VYV0 432 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 BTBD7Q9P203 1132 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 A8MUI8 341 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MMEP08473 750 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP11B1P15538 503 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPA6P17066 643 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GCKP35557 465 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PMS2P54278 862 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GPX6P59796 221 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ZACNQ401N2 412 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 EFHC2Q5JST6 749 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MON1BQ7L1V2 547 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM13CQ8NE31 585 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF287Q9HBT7 754 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 E7EVH7 732 aa3.9□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 GPC3P51654 580 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PARP6Q2NL67 630 aa3.9□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 SLFN12Q8IYM2 578 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRN2Q92932 1015 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DNA2P51530 1060 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PLTPP55058 493 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CDR2Q01850 454 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GAD2Q05329 585 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SV2AQ7L0J3 742 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DAAM2Q86T65 1068 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 NSMCE1Q8WV22 266 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 NINJ2Q9NZG7 142 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRA2Q96PE1 1338 aa3.9□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SPDYE3A6NKU9 549 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 EDF1O60869 148 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBED4O75132 1171 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SGPL1O95470 568 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD2P08910 425 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GAP43P17677 238 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MTFR1Q15390 333 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP2R5EQ16537 467 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 KYNUQ16719 465 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PODNQ7Z5L7 613 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ERICH1Q86X53 443 aa3.89□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ASB3Q9Y575 518 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM120BA0PK00 339 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ENTPD3O75355 529 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 LMNB1P20700 586 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R40P59535 323 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DEF6Q9H4E7 631 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa3.89□□□□□ -1.79
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