RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	CPA6	Q8N4T0	437 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	CHST13	Q8NET6	341 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	JDP2	Q8WYK2	163 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	HDAC10	Q969S8	669 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	PTPN18	Q99952	460 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	BCO1	Q9HAY6	547 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	SCOC	Q9UIL1	159 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	CUL7	Q14999	1698 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	GRIN2B	Q13224	1484 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	SYN1	P17600	705 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	WAS	P42768	502 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	GZMK	P49863	264 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36	9e-9	■■■■■ 30
RPS13-208	ENST00000531908	MCL1	Q07820	350 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	MGAT2	Q10469	447 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	GPR135	Q8IZ08	494 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	NRG4	Q8WWG1	115 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	IL17RA	Q96F46	866 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	LOXL4	Q96JB6	756 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	INTU	Q9ULD6	942 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	DTNB	O60941	627 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	MFAP3L	O75121	409 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	CASR	P41180	1078 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	RAB27A	P51159	221 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	APBA1	Q02410	837 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	ODF1	Q14990	250 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	MST1L	Q2TV78	715 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	D2HGDH	Q8N465	521 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	OR7D4	Q8NG98	312 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	FAM89A	Q96GI7	184 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	SAMD11	Q96NU1	681 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	DEF6	Q9H4E7	631 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	GPR42	O15529	346 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	AKAP10	O43572	662 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF623	O75123	536 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	ITGA10	O75578	1167 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	PTPN7	P35236	360 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	ADAM8	P78325	824 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	6.53	□□□□□ -1.36	5e-17	■■□□□ 11.5
RPS13-208	ENST00000531908	C20orf173	Q96LM9	149 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	LANCL2	Q9NS86	450 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM140	Q9NV12	185 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	EID1	Q9Y6B2	187 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS13-208	ENST00000531908	MAP3K1	Q13233	1512 aa		6.52	□□□□□ -1.37
RPS13-208	ENST00000531908	CYP27B1	O15528	508 aa		6.52	□□□□□ -1.37
RPS13-208	ENST00000531908	TEX33	O43247	280 aa		6.52	□□□□□ -1.37
RPS13-208	ENST00000531908	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
RPS13-208	ENST00000531908	ABLIM3	O94929	683 aa		6.52	□□□□□ -1.37
RPS13-208	ENST00000531908	PF4V1	P10720	104 aa		6.52	□□□□□ -1.37
RPS13-208	ENST00000531908	IL2RB	P14784	551 aa		6.52	□□□□□ -1.37
RPS13-208	ENST00000531908	GNAT2	P19087	354 aa		6.52	□□□□□ -1.37
RPS13-208	ENST00000531908	COMT	P21964	271 aa		6.52	□□□□□ -1.37
RPS13-208	ENST00000531908	AKAP5	P24588	427 aa		6.52	□□□□□ -1.37
RPS13-208	ENST00000531908	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
RPS13-208	ENST00000531908	PTH1R	Q03431	593 aa		6.52	□□□□□ -1.37
RPS13-208	ENST00000531908	PPP3CA	Q08209	521 aa		6.52	□□□□□ -1.37

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