RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 USP4Q13107 963 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 MPP3Q13368 585 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 GDF3Q9NR23 364 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 IL13P35225 146 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PRCPP42785 496 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PPP2R5CQ13362 524 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 SLC18A3Q16572 532 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 M0R3G1 203 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 MXI1P50539 228 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 BTKQ06187 659 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PPARAQ07869 468 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 LONRF1Q17RB8 773 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 BARGINQ6ZT62 677 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 DYMQ7RTS9 669 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 SLF2Q8IX21 1173 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 GIPC3Q8TF64 312 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 TBC1D12O60347 775 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 COQ9O75208 318 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 GSNP06396 782 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 LPIN1Q14693 890 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 RNF220Q5VTB9 566 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 SHC4Q6S5L8 630 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 CFLARO15519 480 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ADSSL1Q8N142 457 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ALOX5P09917 674 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF12P17014 697 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 RNF43Q68DV7 783 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC125Q86Z20 511 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 BLIDQ8IZY5 108 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 MID2Q9UJV3 735 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 AK5Q9Y6K8 562 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 BCL10O95999 233 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 DNM3Q9UQ16 869 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 TJP3O95049 919 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 OR52Z1P0C646 297 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 IL10P22301 178 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 XIAPP98170 497 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.316e-7■■□□□ 13.9
SBNO1-202ENST00000420886 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ZFYVE19Q96K21 471 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 B2RBV5 119 aa6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 OPLAHO14841 1288 aa6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 FGAP02671 866 aa6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 SRGNP10124 158 aa6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 KITP10721 976 aa6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 KCNJ2P63252 427 aa6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 NAT14Q8WUY8 206 aa6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 MYL10Q9BUA6 226 aa6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 GOLGA8RI6L899 631 aa6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 TTLL1O95922 423 aa6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.84□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ABCA6Q8N139 1617 aa6.84□□□□□ -1.31
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