RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635519.1

NRXN1-242, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NRXN1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-242ENST00000635519 ICMTO60725 284 aa6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 SERPINB3P29508 390 aa6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 HSD17B2P37059 387 aa6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 NDUFA5Q16718 116 aa6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 USP43Q70EL4 1123 aa6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 IFNL1Q8IU54 200 aa6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 KSR1Q8IVT5 923 aa6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 GAB3Q8WWW8 586 aa6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 STON2Q8WXE9 905 aa6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 TSKSQ9UJT2 592 aa6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 SATB2Q9UPW6 733 aa6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 LTBP1Q14766 1721 aa6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.13□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 KLHL41O60662 606 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 GUCY1B2O75343 617 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 KCNA3P22001 575 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 GBP1P32455 592 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 ADD2P35612 726 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 HNF1BP35680 557 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 PPP1R2P41236 205 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 AP2B1P63010 937 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 PFKPQ01813 784 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 MTX1Q13505 466 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 NXNQ6DKJ4 435 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 SPATA24Q86W54 205 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 HACE1Q8IYU2 909 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 STK32AQ8WU08 396 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 ALG1Q9BT22 464 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 SELENONQ9NZV5 590 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CTAGE15A4D2H0 777 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 TSPY2A6NKD2 308 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 MATN2O00339 956 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 GMNNO75496 209 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 TRPA1O75762 1119 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 KRT16P08779 473 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CTAGE8P0CG41 777 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 TSPY3P0CV98 308 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 TSPY8P0CW00 308 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 GUCY1A2P33402 732 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 TMF1P82094 1093 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 TSPY1Q01534 308 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CD300CQ08708 224 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 NNTQ13423 1086 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CCDC14Q49A88 953 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CEP78Q5JTW2 689 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CORO6Q6QEF8 472 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 Q6ZNX1 250 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CTAGE6Q86UF2 777 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 NEK6Q9HC98 313 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CRYZL1O95825 349 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 USP14P54578 494 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 TUBB4BP68371 445 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 POLA2Q14181 598 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 SLC51BQ86UW2 128 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 P3H4Q92791 437 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 SNF8Q96H20 258 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 HINFPQ9BQA5 517 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.12□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 GMNCA6NCL1 334 aa6.11□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CFAP73A6NFT4 308 aa6.11□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.11□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 INMTO95050 263 aa6.11□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 GNRH1P01148 92 aa6.11□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 VAV1P15498 845 aa6.11□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 MYL6P60660 151 aa6.11□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
NRXN1-242ENST00000635519 TAF12Q16514 161 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms