RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 BSNDQ8WZ55 320 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 NLRP4Q96MN2 994 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 SCLT1Q96NL6 688 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 H0YCG3 227 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 K7ENM7 598 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 M0QZ92 97 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 NBNO60934 754 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 KIF20AO95235 890 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 GCNT3O95395 438 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CHRNA1P02708 482 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CCDC192P0DO97 292 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ACRP10323 421 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 SCP2P22307 547 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ABCD1P33897 745 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PHKA2P46019 1235 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 NCKAP1LP55160 1127 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 NLRP12P59046 1061 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 TYRO3Q06418 890 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 MGAT3Q09327 533 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 STK4Q13043 487 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 STIM1Q13586 685 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ALCAMQ13740 583 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CAPSQ13938 189 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 MBTPS1Q14703 1052 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 STX1AQ16623 288 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 FAM26DQ5JW98 314 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 DEFB128Q7Z7B8 93 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 RPAINQ86UA6 219 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF410Q86VK4 478 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 KSR1Q8IVT5 923 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 NME8Q8N427 588 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 RNF149Q8NC42 400 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 DEPTORQ8TB45 409 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 NLRP7Q8WX94 980 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 HPS3Q969F9 1004 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 VWCEQ96DN2 955 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PRO3102Q9H379 93 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 IL23AQ9NPF7 189 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ANO10Q9NW15 660 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 DACH1Q9UI36 760 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 UBE4BO95155 1302 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 DENND3A2RUS2 1198 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 SLC16A4O15374 487 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CAND2O75155 1236 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 BMP6P22004 513 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 NMT1P30419 496 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 BMP8BP34820 402 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 RFC2P35250 354 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PPP1R2P41236 205 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 GPC3P51654 580 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 EFNA5P52803 228 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 POU5F1BQ06416 359 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 KIZQ2M2Z5 673 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 TCTN1Q2MV58 587 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 DPCR1Q3MIW9 517 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM240Q5SV17 173 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 C9orf50Q5SZB4 431 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF720Q7Z2F6 126 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 HAUS6Q7Z4H7 955 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 MYOCDQ8IZQ8 938 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 MLKLQ8NB16 471 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 KIAA0895Q8NCT3 520 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 HVCN1Q96D96 273 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 FIZ1Q96SL8 496 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.233e-6■■■■□ 22
PRPF8-210ENST00000574217 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 NFKBIZQ9BYH8 718 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 C2orf40Q9H1Z8 148 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.37□□□□□ -1.23
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