RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486708.1

SFI1-224, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 2

Gene SFI1, Length 651 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-224	ENST00000486708	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	AK5	Q9Y6K8	562 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708		H0YHG0	523 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	MYO1F	O00160	1098 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	TM4SF5	O14894	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	FSCN2	O14926	492 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	ENTPD3	O75355	529 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	BAG3	O95817	575 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	GLB1	P16278	677 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	CMA1	P23946	247 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	MCM3	P25205	808 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	FNTA	P49354	379 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	IRAK1	P51617	712 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	USP14	P54578	494 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	TIMM10	P62072	90 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	PDE4B	Q07343	736 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	TFCP2	Q12800	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	NEDD9	Q14511	834 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	PANX2	Q96RD6	677 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	OSMR	Q99650	979 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	EHD4	Q9H223	541 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	SAMM50	Q9Y512	469 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	NUP98	P52948	1817 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	SCN4A	P35499	1836 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	CLRN2	A0PK11	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	METTL12	A8MUP2	240 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	GOLIM4	O00461	696 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	CHUK	O15111	745 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	ADAM11	O75078	769 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	MFAP3L	O75121	409 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1-224	ENST00000486708	NEBL	O76041	1014 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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