RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439424.6

C17orf49-201, Transcript of chromosome 17 open reading frame 49, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C17orf49, Length 850 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf49-201ENST00000439424 GATMP50440 423 aa26.92■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 EPC2Q52LR7 807 aa26.92■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 TPH2Q8IWU9 490 aa26.92■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 NLRP7Q8WX94 980 aa26.92■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa26.92■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 BRWD1Q9NSI6 2320 aa26.91■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 DENND3A2RUS2 1198 aa26.91■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 GJB2P29033 226 aa26.91■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 SARSP49591 514 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 MCM2P49736 904 aa26.91■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 DSC3Q14574 896 aa26.91■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 ODR4Q5SWX8 454 aa26.91■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 FIBCD1Q8N539 461 aa26.91■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 HSD17B14Q9BPX1 270 aa26.91■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 RGS18Q9NS28 235 aa26.91■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 C9IYK1 514 aa26.9■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 OR52Z1P0C646 297 aa26.9■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 RHPN2Q8IUC4 686 aa26.9■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 KSR1Q8IVT5 923 aa26.9■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 TMEM192Q8IY95 271 aa26.9■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 NEK9Q8TD19 979 aa26.9■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 MYO7AQ13402 2215 aa26.9■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 A0A087WZ62 844 aa26.89■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 DNM2P50570 870 aa26.89■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 XKR9Q5GH70 373 aa26.89■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.89■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 SLC7A3Q8WY07 619 aa26.89■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 SAMD11Q96NU1 681 aa26.89■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 C1orf112Q9NSG2 853 aa26.89■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 KIF3AQ9Y496 699 aa26.89■■□□□ 1.9
C17orf49-201ENST00000439424 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 LYPLA2O95372 231 aa26.88■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 STAG3L1P0CL83 205 aa26.88■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 CTNNB1P35222 781 aa26.88■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 RFC5P40937 340 aa26.88■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 TRAPPC10P48553 1259 aa26.88■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 EMC2Q15006 297 aa26.88■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 TMEM143Q96AN5 459 aa26.88■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 NLRP4Q96MN2 994 aa26.88■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 LRFN2Q9ULH4 789 aa26.88■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 PPME1Q9Y570 386 aa26.88■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 VCANP13611 3396 aa26.88■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 TECP42680 631 aa26.87■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 SLC24A5Q71RS6 500 aa26.87■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 OTUD6AQ7L8S5 288 aa26.87■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.87■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.87■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 A0A087WWV3 80 aa26.86■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 XIRP2A4UGR9 3374 aa26.86■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa26.86■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 MCTP1Q6DN14 999 aa26.86■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 ZNF410Q86VK4 478 aa26.86■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.86■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa26.86■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.86■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 MED24O75448 989 aa26.85■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 PIGOQ8TEQ8 1089 aa26.85■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 THEGQ9P2T0 379 aa26.85■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.85■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa26.85■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 CUL9Q8IWT3 2517 aa26.84■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 H3BNC9 293 aa26.84■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 FGFR1P11362 822 aa26.84■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 GPM6BQ13491 265 aa26.84■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 FAM102BQ5T8I3 360 aa26.84■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 MTRQ99707 1265 aa26.84■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 ANKEF1Q9NU02 776 aa26.84■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 BMPR1AP36894 532 aa26.83■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 RARRES1P49788 294 aa26.83■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 FAM189BP81408 668 aa26.83■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 CDC42EP1Q00587 391 aa26.83■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 POTEGQ6S5H5 508 aa26.83■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 CATSPER3Q86XQ3 398 aa26.83■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 IFT122Q9HBG6 1241 aa26.83■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 TUFT1Q9NNX1 390 aa26.83■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 RNF19AQ9NV58 838 aa26.83■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 TMEM161AQ9NX61 479 aa26.83■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 LMCD1Q9NZU5 365 aa26.83■■□□□ 1.89
C17orf49-201ENST00000439424 HCSTQ9UBK5 93 aa26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms