RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TSSK1BQ9BXA7 367 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PKD2L2Q9NZM6 624 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SNX5Q9Y5X3 404 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MYO1CO00159 1063 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 HPDP32754 393 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FIGNQ5HY92 759 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 C2orf69Q8N8R5 385 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MBD2Q9UBB5 411 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PNMA3Q9UL41 463 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MYH7BA7E2Y1 1941 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PIK3R2O00459 728 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFA10O95299 355 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TFDP2Q14188 446 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ARMC3Q5W041 872 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 P2RX5Q93086 422 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CHMP6Q96FZ7 201 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 VPS39Q96JC1 886 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FGD4Q96M96 766 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 KLC2Q9H0B6 622 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 VAT1LQ9HCJ6 419 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 WDR35Q9P2L0 1181 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MRFAP1Q9Y605 127 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MEGF6O75095 1541 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6V1E1P36543 226 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RAP1GAPP47736 663 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ARL4CP56559 192 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CNGA2Q16280 664 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 EXOC3L4Q17RC7 722 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MFSD14BQ5SR56 506 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FAM160B1Q5W0V3 765 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 KLHDC4Q8TBB5 520 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PIK3R5Q8WYR1 880 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 VPS33BQ9H267 617 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 KLC4Q9NSK0 619 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 HEG1Q9ULI3 1381 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 LGALS16A8MUM7 142 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 H3BQF6 201 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 OPLAHO14841 1288 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CCNE1P24864 410 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CORO7P57737 925 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FRMD5Q7Z6J6 570 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ERICH1Q86X53 443 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CPLX3Q8WVH0 158 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TSPAN17Q96FV3 270 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CATSPER2Q96P56 530 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PRRG3Q9BZD7 231 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PRDM10Q9NQV6 1147 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NRXN1Q9ULB1 1477 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CDH16O75309 829 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 KCTD2Q14681 263 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NAALADL2Q58DX5 795 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 IKBIPQ70UQ0 350 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SRLQ86TD4 932 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SKAP1Q86WV1 359 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NECAB1Q8N987 351 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CEP95Q96GE4 821 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 LRWD1Q9UFC0 647 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 COL15A1P39059 1388 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NEURL1BA8MQ27 555 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PFKFB1P16118 471 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 AFMP43652 599 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 GSTA3Q16772 222 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TXNRD1Q16881 649 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FAM47CQ5HY64 1035 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TMCO4Q5TGY1 634 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CABP7Q86V35 215 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ATP11CQ8NB49 1132 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SEPT8Q92599 483 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NCLNQ969V3 563 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SLC10A4Q96EP9 437 aa5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms