RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	LAMA4	Q16363	1823 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	PFKFB2	O60825	505 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	GH2	P01242	217 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	LIFR	P42702	1097 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	TROAP	Q12815	778 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	STK3	Q13188	491 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	NTRK3	Q16288	839 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	SGO2	Q562F6	1265 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC6A19	Q695T7	634 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	APOA5	Q6Q788	366 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	HID1	Q8IV36	788 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACER1	Q8TDN7	264 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ESR2	Q92731	530 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM87B	Q96K49	555 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOMM22	Q9NS69	142 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR90	Q96KV7	1748 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSPY2	A6NKD2	308 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAMTS3	O15072	1205 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	HLA-DOA	P06340	250 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	PKP1	Q13835	747 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	NKG7	Q16617	165 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	GTF3C6	Q969F1	213 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDCA5	Q96FF9	252 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	CPVL	Q9H3G5	476 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIDD1	Q9HB75	910 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	GMIP	Q9P107	970 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	SWAP70	Q9UH65	585 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFRSF10C	O14798	259 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYO1B	O43795	1136 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSPY3	P0CV98	308 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSPY8	P0CW00	308 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ETFB	P38117	255 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ECE1	P42892	770 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRDN	Q13061	729 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRKG1	Q13976	671 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	WTAP	Q15007	396 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	DGKH	Q86XP1	1220 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26

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