RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 NAB1Q13506 487 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TFDP1Q14186 410 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MFSD4BQ5TF39 518 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FBXL16Q8N461 479 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MAP4K1Q92918 833 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PBXIP1Q96AQ6 731 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 EXOC3O60645 756 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 KRT7P08729 469 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 UGP2Q16851 508 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RESP18Q5W5W9 173 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NCAPH2Q6IBW4 605 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PRMT9Q6P2P2 845 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PARP9Q8IXQ6 854 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SNX29Q8TEQ0 813 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RILPQ96NA2 401 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 WWP1Q9H0M0 922 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PHEXP78562 749 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 INAQ16352 499 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 LONRF3Q496Y0 759 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 DCUN1D2Q6PH85 259 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MAGEB6Q8N7X4 407 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SPATA5Q8NB90 893 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF398Q8TD17 642 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 XAGE2Q96GT9 111 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC134Q9H6E4 229 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NARFQ9UHQ1 456 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SNTNA6NMZ2 147 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA8RI6L899 631 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 A1BGP04217 495 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SKIDA1Q1XH10 827 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 AADATQ8N5Z0 425 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FAM227BQ96M60 508 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SERPINI2O75830 405 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MBD4O95243 580 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 BFSP1Q12934 665 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 GRAPQ13588 217 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CYFIP1Q7L576 1253 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PDIK1LQ8N165 341 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CFAP36Q96G28 342 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 AZI2Q9H6S1 392 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MTMR6Q9Y217 621 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 LSM1O15116 133 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ADCY3O60266 1144 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TBC1D8O95759 1140 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TSHRP16473 764 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CCT5P48643 541 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CCT2P78371 535 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 INPP5AQ14642 412 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PLS1Q14651 629 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 COG1Q8WTW3 980 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CNBD2Q96M20 576 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MAGEE1Q9HCI5 957 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 GID8Q9NWU2 228 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 H0YC42 278 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 AFPP02771 609 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 IFNAR1P17181 557 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MSH2P43246 934 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 BEST2Q8NFU1 509 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CENPTQ96BT3 561 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 EPAS1Q99814 870 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TRAIPQ9BWF2 469 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 COA1Q9GZY4 146 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 LGR6Q9HBX8 967 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MYOM1P52179 1685 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FKBP6O75344 327 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TNNC2P02585 160 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MYL4P12829 197 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CIITAP33076 1130 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CYP2C19P33261 490 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RASGRF1Q13972 1273 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 BLIDQ8IZY5 108 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB18Q99592 522 aa5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms